Nøkkelforskjellen mellom cis- og trans-spleising er at cis-spleising er en intramolekylær mekanisme som fjerner introner og forbinder eksonene som er innenfor samme RNA-transkript, mens trans-spleising er en intermolekylær mekanisme som fjerner introner eller outroner og slår seg sammen med eksonene som ikke er innenfor samme RNA-transkript.
RNA-spleising er en form for RNA-behandling før proteinsyntese. I denne prosessen blir et nylaget pre-messenger-RNA-transkript transformert til et modent messenger-RNA. Moden messenger-RNA hjelper til med å produsere et proteinmolekyl. Under RNA-spleising fjernes intronene (ikke-kodende regioner) og eksoner (kodende regioner) kobles sammen for å lage modent mRNA. Cis- og trans-spleising er to typer RNA-spleisingmekanismer.
Hva er Cis-spleising?
Cis-spleising er en intramolekylær mekanisme som fjerner introner og forener eksonene som er innenfor samme RNA-transkript. Normal cis-spleising behandler et enkelt RNA-molekyl. Cis-spleising er den typiske skjøteprosessen av pre-mRNA utført av spleiseosomer. I intronet er et donorsted (5'-enden av intronet), et grensted (nær 3'-enden av intronet) og et akseptorsted (3'-enden av intronet) svært essensielle for spleising. Spleisedonorstedet inkluderer en invariant sekvens GU ved 5'-enden av intronet. Spleiseakseptorstedet ved 3'-enden av intronet har en invariant AG-sekvens. Oppstrøms fra AG-sekvensen er det en region som kalles pyrimidinregionen (polypyrimidinkanalen). Lenger oppstrøms fra polypyrimidinkanalen er det et forgreningspunkt som inkluderer et adenosinukleotid. Dette nukleotidet er involvert i lariatdannelse.
Figur 01: Cis- og transspleising
De viktigste spleisosomene er U1, U2, U4, U5 og U6. Blant dem er U1 og U2 svært viktige. Ved cis-spleising binder U1 seg til 5'-spleisestedet, og U2 binder seg til grenpunktet nær 3'-spleisestedet. U5/U4/U6 binder eksoner på 5'-stedet, med U6-binding til U2. Senere slippes U1. U5 skifter fra ekson til intron, og U6 binder seg på 5'-spleisestedet. Videre slippes også U4. U6/U2 katalyserer transesterifisering, og får 5'-enden av intronet til å ligere til A-nukleotidet på intron. Dette utløser lariatdannelse. I dannelsen av et lariat binder U5 ekson på 3'-spleisestedet, og 5'-stedet sp altes. I sluttfasen av skjøtingen forblir U2/U5/U6 bundet til lariatet, og 3'-stedet sp altes. I tillegg til det ligeres eksonene ved bruk av ATP-hydrolyse i denne fasen.
Hva er transspleising?
Trans-spleising er en intermolekylær mekanisme som fjerner introner eller outroner og forener eksonene som ikke er innenfor samme RNA-transkript. Ved trans-spleising er det ikke noe 5'-spleisested på pre-mRNA-molekylet for U1-protein å binde. I stedet trans-spleises RNA med avkortet spleiseleder (SL) til sekvens i utronen.
Figur 02: Transspleising
Outron er en region av pre-mRNA mellom 5'-hetten og trans-spleisestedet. Imidlertid binder U2-protein seg til 3'-spleisestedet vanligvis. Etter fjerning av outron, spleises spleiseleder-eksonet (SL) til det første eksonet på pre-mRNA. Videre er trans-spleising en mekanisme som observeres i visse mikroorganismer som protister av Kinetoplastae-klassen for å uttrykke gener.
Hva er likhetene mellom cis- og transspleising?
- Cis- og transspleising er to typer RNA-spleisingmekanismer.
- I begge mekanismene fjernes introner.
- I begge mekanismene er eksoner også forbundet for å danne modent mRNA.
- Begge mekanismer finnes i eukaryoter.
- Disse mekanismene er fraværende i prokaryoter.
Hva er forskjellen mellom cis- og transspleising?
Cis-spleising er en intramolekylær mekanisme som fjerner introner og forbinder eksonene som er innenfor samme RNA-transkript, mens trans-spleising er en intermolekylær mekanisme som fjerner introner eller outroner og forbinder eksonene som ikke er innenfor samme RNA. transkripsjon. Så dette er nøkkelforskjellen mellom cis- og trans-spleising. Videre, i cis-spleising, fjernes introner for å danne modent mRNA. På den annen side, ved trans-spleising fjernes introner eller outroner for å danne modent mRNA.
Den følgende infografikken viser forskjellene mellom cis- og trans-spleising i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – Cis vs Trans Splicing
RNA-spleising er en form for RNA-behandling før proteinsynteseprosessen. Cis- og trans-spleising er to typer RNA-spleisingmekanismer som finnes i eukaryoter. Cis-spleising er en intramolekylær mekanisme som fjerner introner og forbinder eksonene som er innenfor samme RNA-transkript, mens trans-spleising er en intermolekylær mekanisme som fjerner introner eller outroner og forbinder eksonene som ikke er innenfor samme RNA-transkript. Dermed avslutter dette diskusjonen om forskjellen mellom cis- og transspleising.
