Nøkkelforskjellen mellom DNA-transposoner og retrotransposoner er at DNA-transposoner er mobile genetiske elementer som beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en klippe- og limmekanisme, mens retrotransposoner er mobile genetiske elementer som beveger seg fra ett sted til en annen i genomet ved å bruke kopier og lim-mekanisme.
Mobile genetiske elementer (MGE) er segmenter av DNA som koder for spesifikke enzymer og proteiner som medierer deres bevegelse innenfor genomet, eller som kan overføres fra en art til en annen. De er også kjent som egoistiske genetiske elementer. Transponerbare elementer representerer en av flere typer mobile genetiske elementer. Det er to hovedtyper av transposerbare elementer: DNA-transposoner og retrotransposoner. Derfor er DNA-transposoner og retrotransposoner mobile genetiske elementer som kan bevege seg fra sted til sted i genomet.
Hva er DNA-transposoner?
DNA-transposoner er mobile genetiske elementer som beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en klippe- og limmekanisme. De tilhører klasse II transponerbare elementer som beveger seg gjennom et DNA-mellomprodukt. Dette er i motsetning til klasse I transposerbare elementer (retrotransposoner) som beveger seg gjennom et RNA-mellomprodukt. Norm alt beveger DNA-transposoner seg rundt i genomet ved å bruke en klipp og lim metode. Denne metoden krever et transposase-enzym som katalyserer bevegelsen av DNA fra dets nåværende plassering i genomet og innsetting på det nye stedet.
Figur 01: DNA-transposoner
Denne transposisjonen krever tre DNA-steder på transposonet (to i hver ende av transposonet k alt terminale inverterte repetisjoner og ett på målstedet). Transposase-enzymet vil binde seg til de terminale inverterte repetisjonene av transposonet og medierer synapsis av transposonendene. Deretter kobler transposase-enzymet elementet fra det flankerende DNA-et til det opprinnelige donorstedet og medierer sammenføyningen av transposonet til det nye innsettingsstedet i genomet. Tillegget av transposon til den nye plasseringen forårsaker korte hull på hver side av det innsatte segmentet. Vertssystemer reparerer disse hullene, noe som resulterer i målsekvensduplisering (TSD), som er karakteristisk for transposisjon.
Hva er retrotransposoner?
Retrotransposoner er mobile genetiske elementer som beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en kopi- og limmekanisme. De tilhører klasse I transponerbare elementer. Klasse I transposerbare elementer (retrotransposoner) beveger seg gjennom et RNA-mellomprodukt i genomet. De er en type genetisk komponent som kopierer og limer seg inn på forskjellige genomiske steder.
Figur 02: Retrotransposons
Først blir de transkribert fra DNA til RNA. Deretter blir det produserte RNA revers transkribert til DNA. Dette kopierte DNA blir senere satt inn i genomet på et nytt sted. Revers transkripsjon katalyseres av revers transkriptase. Revers transkriptase er ofte kodet av retrotransposon selv. Integreringen utføres av et enzym k alt integrase. Videre er det vanligvis tre typer: lange terminalrepetisjoner (LTR), lange interspersed nukleære elementer (LINE) og korte interspersed nukleære elementer (SINE).
Hva er likhetene mellom DNA-transposoner og retrotransposoner?
- DNA-transposoner og retrotransposoner er mobile genetiske elementer.
- Begge er klassifisert under transponerbare elementer.
- Begge er kjent som hoppgener.
- De kan bevege seg fra sted til sted i genomet.
- De er evolusjonære veldig viktige.
Hva er forskjellen mellom DNA-transposoner og retrotransposoner?
DNA-transposoner er mobile genetiske elementer som beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en klippe- og limmekanisme, mens retrotransposoner er mobile genetiske elementer som beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en kopi og lim mekanisme. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom DNA-transposoner og retrotransposoner. Videre tilhører DNA-transposoner klasse II transposerbare elementer, mens retrotransposoner tilhører klasse I transposerbare elementer.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom DNA-transposoner og retrotransposoner i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – DNA-transposoner vs retrotransposoner
DNA-transposoner og retrotransposoner er mobile genetiske elementer. DNA-transposoner beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en cut-paste-mekanisme. Retrotransposoner beveger seg fra ett sted til et annet i genomet ved å bruke en kopi- og limmekanisme. Så dette oppsummerer forskjellen mellom DNA-transposoner og retrotransposoner.
