Nøkkelforskjellen mellom T4 DNA-ligase og E. coli DNA-ligase er at T4 DNA-ligase er et enzym som er isolert fra bakteriofag T4 mens E. coli DNA-ligase er et enzym som er isolert fra bakterien E. coli.
DNA-ligase er en spesifikk type enzym som letter sammenføyningen av DNA-tråder gjennom dannelsen av en fosfodiesterbinding. Det spiller en viktig rolle ved å reparere enkelttrådsbrudd og dobbelttrådsbrudd i DNA til levende organismer. Dessuten brukes DNA-ligase i både DNA-reparasjon og DNA-replikasjon. Bortsett fra de ovennevnte bruksområdene, har DNA-ligase også omfattende bruk i molekylærbiologiske eksperimenter som rekombinant DNA-teknologi. T4 DNA-ligase og E. coli DNA-ligase er to typer DNA-ligaseenzymer.
Hva er T4 DNA-ligase?
T4-ligase er et DNA-sammenføyningsenzym som er isolert fra bakteriofag T4. T4 bakteriofag er et virus som infiserer Escherichia coli. T4-ligaseenzym er den mest brukte DNA-ligasen i molekylærbiologisk laboratorieforskning. Norm alt katalyserer T4-ligase sammenføyningen av to kohesive eller stumpende tråder av dobbelttrådet DNA mellom 5'-fosfat- og 3'-hydroksylgruppene til tilstøtende nukleotider. Det kan også katalysere sammenføyningen av RNA til enten en DNA- eller RNA-streng i et dupleksmolekyl. Dette enzymet vil imidlertid ikke bli med enkelttrådede nukleinsyrer. Dessuten kan den også ligere stumpendet DNA med mye større effektivitet enn E. coli DNA-ligase.
Figur 01: T4 DNA-ligase
Dette enzymet krever ATP som en kofaktor. Noen genteknologiske forskningseksperimenter har allerede produsert mer aktive DNA-ligaseenzymer enn villtype T4 DNA-ligase. I en av tilnærmingene skapte de et fusjonsenzymmolekyl ved å kjemme T4 DNA-ligase til enten p50- eller NF-kB-molekyl. Dette nye T4-ligaseenzymet var 160 % mer aktivt i stumpende ligeringer for kloningsformål enn villtype T4 DNA-ligase. Videre er den optimale temperaturen for T4 DNA-ligase for å katalysere ligeringsreaksjonen mer presist 16 °C.
Hva er E Coli DNA Ligase?
E. coli DNA-ligase er et enzym som er isolert fra E. coli-bakterier. Genet som er ansvarlig for å lage E. coli DNA-ligase er lig-genet. E. coli-DNA, ligase så vel som de fleste prokaryote DNA-ligaser, bruker energi som oppnås av NAD (nikotinamidadenindinukleotid) for å lage fosfodiesterbindingen.
Figur 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA-ligase er et ligeringsenzym som kan slå sammen DNA-fragmenter ved å katalysere dannelsen av fosfodiesterbindinger mellom dobbelttrådete DNA-fragmenter som inneholder 5' fosfattermini og 3' hydroksyltermini. Dessuten ligerer den ikke stumpendet DNA bortsett fra under spesielle forhold som molekylær fortrengning med polyetylenglykol. Det kan heller ikke koble RNA til DNA effektivt. Videre kan aktiviteten til E. coli DNA-ligase forsterkes ved tilstedeværelse av DNA-polymerase 1 i riktig konsentrasjon. Men når konsentrasjonen av DNA-polymerase 1-enzym er høyere, har det negative effekter på E. coli DNA-ligaseaktivitet.
Hva er likhetene mellom T4 DNA Ligase og E Coli DNA Ligase?
- T4 DNA-ligase og E-coli DNA-ligase er to typer DNA-ligaseenzymer.
- Begge er proteiner som består av aminosyrer.
- Disse enzymene katalyserer dannelsen av en fosfodiesterbinding mellom sidestilt 5' fosfat og 3' hydroksyltermini i dupleks DNA.
- De har omfattende bruk i molekylærbiologiske eksperimenter som rekombinant DNA-teknologi.
Hva er forskjellen mellom T4 DNA Ligase og E Coli DNA Ligase?
T4 DNA-ligase er et enzym som er isolert fra bakteriofag T4 mens E. coli DNA-ligase er et enzym som er isolert fra E. coli-bakterier. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom T4 DNA-ligase og E. coli DNA-ligase. Videre er energikilden for T4 DNA-ligase ATP. På den annen side er energikilden for E. coli DNA-ligase NAD.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom T4 DNA-ligase og E coli DNA-ligase i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 DNA-ligase og E. coli DNA-ligase er to enzymer som katalyserer dannelsen av en fosfodiesterbinding mellom sidestilt 5' fosfat og 3' hydroksyltermini i dupleks DNA. T4-ligase er et enzym som er isolert fra bakteriofag T4 mens E. coli DNA-ligase er et enzym som er isolert fra E. coli-bakterier. Så dette er nøkkelforskjellen mellom T4 DNA-ligase og E coli DNA-ligase.
