Nøkkelforskjellen mellom cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA er at cellefritt DNA er ulike former for DNA som sirkulerer fritt i blodet, mens sirkulerende tumor-DNA er det fragmenterte tumoravledede DNAet som sirkulerer i blodet.
Cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA er to typer sirkulerende nukleinsyrer. Sirkulerende nukleinsyrer ble oppdaget av Mandel og Metal i 1948. Senere ble det oppdaget at mengden av sirkulerende nukleinsyrer hos syke pasienter er betydelig høy. Denne oppdagelsen ble først gjort i forhold til lupuspasienter. Videre har sirkulerende nukleinsyrer en høyere prognostisk verdi og kan brukes som en biomarkør for å oppdage ulike sykdommer.
Hva er cellefritt DNA?
Cellefritt DNA (Cf DNA) refererer til ulike former for DNA som sirkulerende tumor-DNA, cellefritt mitokondrielt DNA og cellefritt føt alt DNA, etc., som fritt sirkulerer i blodet. De forhøyede nivåene av cellefritt DNA observeres ved avanserte sykdommer som kreft, traumer, sepsis, hjerteinfarkt, diabetes, slag, sigdcellesykdom, etc. I tillegg til kreft og fostermedisin er cellefritt DNA en nyttig biomarkør for en mange plager. Dette DNAet kan også brukes til å oppdage transplantasjonstransplantatavvisning. De brukes også til å bestemme vanlig stress, prenatal kjønnskjennelse og i farskapstesting.
Figur 01: Cellefritt DNA
Et cellefritt DNA er vanligvis et dobbelttrådet ekstracellulært molekyl av DNA. Den består av små fragmenter (50 til 200 bp) og større fragmenter (21 kb). Videre har den allerede blitt anerkjent som en pålitelig biomarkør for diagnostisering av prostata- og brystkreft. Cellefritt DNA sirkulerer hovedsakelig i blodet som nukleosomer. Nukleosomer er kjernekomplekser av histoner og DNA. Cf DNA kan kvantifiseres ved hjelp av forskjellige teknikker som PCR, massivt parallell sekvensering, ultrafiolett spektrometri, PicoGreen-farging og ELISA. Siden Cf DNA-deteksjon i blodet er en rask, enkel, ikke-invasiv, repeterende metode, vil den i fremtiden være en potensiell biomarkør for å diagnostisere en rekke sykdommer som autoimmune revmatiske sykdommer og svulster.
Hva er sirkulerende tumor-DNA?
Sirkulerende tumor-DNA (Ct-DNA) er det fragmenterte tumoravledede DNA-et som sirkulerer i blodet. Den har en svulstopprinnelse. Siden en sirkulerende svulst kan reflektere hele svulstens genom, har den fått stor tiltrekning for sin potensielle nytte i kliniske oppsett. Flytende biopsier, som trekker blod, kan brukes til å teste sirkulerende svulster.
Figur 02: Sirkulerende tumor-DNA
De biologiske prosessene som sannsynligvis er involvert i frigjøring av Ct-DNA inkluderer apoptose og nekrose fra døende celler eller aktiv frigjøring fra tumorceller. I friskt vev kan infiltrerende fagocytter fjerne Ct-DNA. Videre kan ulike teknikker brukes til å analysere sirkulerende tumor-DNA som dråper digital PCR, BEAMing, CAPP-Seq (dyp sekvensering), sikker sekvensering og dupleks sekvensering.
Hva er likhetene mellom cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA?
- Cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA er to typer sirkulerende nukleinsyrer.
- De består av nukleotider.
- Begge typer kan brukes som potensielle markører for å diagnostisere ulike sykdommer i kliniske oppsett.
- De finnes i blodet.
- Begge er ekstracellulære former av DNA-molekyler.
- De blir begge ryddet opp av infiltrerende fagocytter.
Hva er forskjellen mellom cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA?
Cellefritt DNA er ulike former for DNA som sirkulerende tumor-DNA, cellefritt mitokondrielt DNA og cellefritt føt alt DNA, etc., som fritt sirkulerer i blodet, mens sirkulerende tumor-DNA er det fragmenterte tumoravledede DNA-et. som sirkulerer i blodet. Så dette er nøkkelforskjellen mellom cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA. Videre sirkulerer cellefritt DNA i fragmenter fra 50-220 bp, mens sirkulerende tumor-DNA sirkulerer i fragmenter fra 134-144 bp.
Følgende infografikk viser forskjellen mellom cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA i tabellform for sammenligning side ved side.
Sammendrag – Cellefritt DNA vs sirkulerende tumor-DNA
Sirkulerende nukleinsyrer kastes inn i blodet gjennom regulerte eller tilfeldige mekanismer. Cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA er to typer sirkulerende nukleinsyrer. Cellefritt DNA er forskjellige former for DNA som sirkulerende tumor-DNA, cellefritt mitokondrielt DNA, cellefritt føt alt DNA som fritt sirkulerer i blodet mens sirkulerende tumor-DNA er det fragmenterte tumoravledede DNAet som sirkulerer i blodet. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom cellefritt DNA og sirkulerende tumor-DNA.
