Nøkkelforskjellen mellom restriksjonsendonuklease og eksonuklease er at restriksjonsendonuklease er et nukleaseenzym som gjenkjenner en spesifikk DNA-sekvens og sp alter DNA i eller ved siden av den sekvensen, mens eksonuklease er et nukleaseenzym som sp alter nukleotidene i en polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden én om gangen.
Nukleaser er enzymene som sp alter fosfodiesterbindinger mellom nukleotider av nukleinsyrer. I levende organismer er de essensielle verktøy for mange aspekter av DNA-reparasjon i cellen. Defekter av disse enzymene kan forårsake genetisk ustabilitet og immunsvikt. Restriksjonsnukleasene er spesifikke nukleaser hvis funksjon er avhengig av en spesifikk nukleotidsekvens. Et eksempel er restriksjonsendonuklease. Det er en grunnleggende klassifisering for nukleaser basert på aktivitetsstedet, slik som endonuklease og eksonuklease. Endonuklease fordøyer områder i midten av mål-DNA-molekylet. Eksonuklease fordøyer nukleinsyrer fra endene. Derfor er restriksjonsendonuklease og eksonuklease to typer nukleaseenzymer.
Hva er restriksjonsendonuklease?
Restriksjonsendonuklease er et nukleaseenzym som gjenkjenner en spesifikk DNA-sekvens og sp alter DNA i eller ved siden av denne sekvensen. Den spesifikke DNA-sekvensen er kjent som restriksjonsstedet. Det kalles også et restriksjonsenzym eller restriktase. Restriksjonsendonukleasen er et veldig spesifikt enzym. Det er en klasse av den bredere endonukleasegruppen av enzymer. Restriksjonsendonukleaser er vanligvis klassifisert i fem typer, som er forskjellige i deres struktur og evne til å kutte DNA-substratet på gjenkjennelsesstedet. De fem typene er type I, type II, type III, type IV og type V.
Figur 01: Restriksjonsendonuklease
Restriksjonsendonukleaser finnes vanligvis i bakterier og arkea. De gir en forsvarsmekanisme for bakterier mot virus. Det er mer enn 3600 kjente restriksjonsendonukleaser. De representerer over 250 forskjellige spesifisiteter. Over 3000 av disse er studert i detalj. Videre er mer enn 800 av disse tilgjengelig kommersielt.
Hva er eksonuklease?
Eksonuklease er et nukleaseenzym som sp alter nukleotidene i et polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden en om gangen. Dette skjer gjennom en hydrolysereaksjon som bryter fosfodiesterbindinger mellom nukleotidene på slutten. Eukaryoter og prokaryoter har tre typer eksonukleaser. Disse eksonukleasene er involvert i den normale omsetningen av mRNA. De er 5' til 3' eksonuklease (Xrn1), 3' til 5' eksonuklease og poly-A-spesifikk 3' til 5' eksonuklease. 5' til 3' eksonuklease er et avhengig avkappingsprotein. 3' til 5' eksonuklease er et uavhengig protein. Poly A-spesifikk 3'- til 5'-eksonuklease er også kjent som poly-A-spesifikk ribonuklease involvert i eksonukleolytisk nedbrytning av poly-A-hale.
Figur 02: Exonuclease
I både archaea og eukaryoter utføres RNA-nedbrytning av multiprotein-eksosomkomplekset som består av 3' til 5' exoribonukleaser.
Hva er likhetene mellom restriksjonsendonuklease og eksonuklease?
- Restriksjonsendonuklease og eksonuklease er to typer nukleaseenzymer.
- Begge enzymer kutter DNA-molekyler.
- Disse enzymene finnes i prokaryoter.
- De er proteiner.
Hva er forskjellen mellom restriksjonsendonuklease og eksonuklease?
Restriksjonsendonuklease er et nukleaseenzym som gjenkjenner en spesifikk DNA-sekvens og sp alter DNA i eller ved siden av den sekvensen, mens eksonuklease er et nukleaseenzym som sp alter nukleotidene i et polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden en om gangen. Så dette er nøkkelforskjellen mellom restriksjonsendonuklease og eksonuklease. Dessuten finnes restriksjonsendonuklease bare i prokaryoter, mens eksonuklease finnes i både prokaryoter og eukaryoter.
Følgende infografikk viser forskjellene mellom restriksjonsendonuklease og eksonuklease i tabellform for sammenligning side ved side.
Sammendrag – Restriksjon Endonuklease vs Eksonuklease
Nukleaser er enzymene som bryter fosfodiesterbindinger mellom nukleotider av nukleinsyrer. Restriksjonsendonuklease og eksonuklease er to typer nukleaseenzymer. Restriksjonsendonuklease er et nukleaseenzym som gjenkjenner en spesifikk DNA-sekvens og sp alter DNA i eller ved siden av denne sekvensen. Eksonuklease er et nukleaseenzym som sp alter nukleotidene i et polynukleotid fra enten 5'-enden eller 3'-enden en om gangen. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom restriksjonsendonuklease og eksonuklease.
