Hva er forskjellen mellom Xylene Cyanol og Bromophenol Blue

2024 Forfatter: Alex Aldridge | [email protected]. Sist endret: 2023-12-17 13:46

Nøkkelforskjellen mellom xylencyanol og bromfenolblått er at i 1 % agarosegel migrerer xylencyanol saktere, mens bromfenolblått migrerer raskere.

Xylencyanol og bromfenolblått er viktige som fargemarkører som kan brukes til å overvåke prosessen med agarosegelelektroforese og polyakrylamidgelelektroforese.

Hva er Xylene Cyanol?

Xylene cyanol er en elektroforetisk fargemarkør eller et sporingsfargestoff. Det er nyttig for å overvåke prosessen med agarosegelelektroforese og polyakrylamidgelelektroforese. Når dette stoffet blandes med prøven, blir konsentrasjonen av dette stoffet typisk omtrent 0.005 % til 0,03 %. Noen synonymer som vi kan bruke for xylencyanol inkluderer Acid Blue 147, xylencyanol, xylencyanol FF, xylencyanol FF, etc.

Den kjemiske formelen til denne forbindelsen er C₂₅H₂₇N₂NaO 6_S2 _{Den molare massen til xylencyanol er 538,61 g/mol. Dette stoffet kan migrere med en hastighet på ca. 4 – 5 kilobasepar DNA-fragmenter i 1 % agarosegeler. Dette avhenger imidlertid av bufferen vi bruker. Vanligvis kan xylencyanol på 6 % polyakrylamidgel migrere med en hastighet på omtrent 140 basepar DNA-fragmenter. På den annen side kan den migrere i 20 % denaturerende polyakrylamidgelelektroforese med en hastighet på 25 baser oligonukleotid.}

Hydrenbindingsgivertallet for xylencyanol er 2m, og hydrogenbindingsakseptortallet er 8. Antallet roterbare bindinger til denne forbindelsen kan angis som 7. Kompleksiteten til xylencyanol kan beskrives som 1120 grader. Den har et definert bindingsstereosentertall på 1.

Hva er bromfenolblått?

Bromfenolblått er en nyttig pH-indikator som er nyttig som en elektroforetisk fargemarkør og et fargestoff. Den har det kjemiske navnet 3', 3", 5', 5"-tetrabromfenolsulfonftalein, BPB. Den kjemiske formelen til denne forbindelsen er C₁₉H₁₀Br₄O_{5 S. Den molare massen til denne forbindelsen er 669,96 g/mol. Den er luktfri, og dens tetthet kan gis til 2,2 g/ml. Smeltepunktet er 273 grader Celsius, og kokepunktet er 279 grader Celsius. Vi kan tilberede den ved sakte å tilsette overflødig brom til en varm løsning av fenolsulfonftalein i iseddik.}

Bromfenolblått er nyttig som en syre-base-indikator i området mellom pH 3,0 til 4,6. Den er i stand til å endre seg fra gul ved pH 3,0 til pH 4,6. Dessuten er det en reversibel reaksjon. Strukturelt ligner bromfenolblått på fenolftalein.

Dessuten kan vi bruke den som en fargemarkør for å overvåke prosessen med agarosegelelektroforese og polyakrylamidgelelektroforese. Dette stoffet kan bære en negativ ladning ved moderat pH, hvor det kan migrere i samme retning som DNA eller protein i en gel. Migrasjonshastigheten kan variere i henhold til geltetthet og buffersammensetning. I en typisk 1 % agarosegel i 1 gang TAE-buffer eller TBE-buffer migrerer imidlertid dette stoffet med samme hastighet som et DNA-fragment på ca. 300 basepar.

Hva er forskjellen mellom xylencyanol og bromfenolblått?

Xylencyanol og bromfenolblått er viktige fargemarkører. Hovedforskjellen mellom xylencyanol og bromfenolblått er at i 1 % agarosegel migrerer xylencyanol saktere, mens bromfenolblått migrerer raskere.

Nedenfor er en oppsummering av forskjellen mellom xylencyanol og bromfenolblått i tabellform for side-ved-side-sammenligning.

Sammendrag – Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue

Xylencyanol og bromfenolblått er viktige som fargemarkører som brukes til å overvåke prosessen med agarosegelelektroforese og polyakrylamidgelelektroforese. Hovedforskjellen mellom xylencyanol og bromfenolblått er at i 1 % agarosegel migrerer xylencyanol langsommere, mens bromfenolblått migrerer raskere.