Nøkkelforskjellen mellom snRNA og snoRNA er at snRNA involverer alternativ spleising av pre-mRNA, mens snoRNA involverer modifisering av rRNA og tRNA, mRNA-redigering og genomimprinting.
Små RNA er polymere RNA-molekyler som består av mindre enn 200 nukleotider. De er vanligvis ikke-kodende. De eksisterer blant messenger-RNA-er for å bære signaler. Små RNA stammer fra perfekt dobbelttrådet RNA, som produseres ved virkningen av RNA-avhengig RNA-polymerase. Små RNA spiller en viktig rolle i celledifferensiering, vekst og spredning, apoptose, metabolisme, migrasjon og forsvar. Derfor er små RNA viktige og kritiske regulatorer for utvikling og fysiologi. Lite nukleært RNA og lite nukleolært RNA er to klasser av små RNA-molekyler.
Hva er snRNA?
Små kjernefysiske RNA eller snRNA er en klasse av små RNA-molekyler som finnes i kjernen til eukaryote celler. Den gjennomsnittlige lengden av et snRNA er omtrent 150 nukleotider. RNA polymerase II eller RNA polymerase III transkribere snRNA. Hovedfunksjonen til snRNA er behandlingen av pre-budbringer-RNA i kjernen. De bidrar også til å regulere transkripsjonsfaktorer eller RNA-polymerase II og opprettholde telomerer.
Figur 01: Virkningsmekanisme for lite RNA
Det er to klasser av snRNA basert på vanlige sekvenstrekk og assosierte proteinfaktorer som RNA-bindende LSm-protein. De to klassene er Sm-klasse snRNA og Lsm-klasse snRNA. Sm-klasse snRNA består av høyt uridininnhold av U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 og U12. RNA polymerase II transkriberer SM-klasse snRNA. Etter transkripsjonen av pre-snRNA mottar de vanligvis en 7-metylguanosin 5'-hette i kjernen. Deretter eksporteres de til cytoplasmaet gjennom kjernefysiske porer for videre prosessering. Lsm-klasse snRNA har et høyt uridininnhold av U6 og U6atac. RNA-polymerase III transkriberer Lsm-klasse snRNA, og det forlater ikke kjernen. De vanligste menneskelige snRNA-komponentene er U1 spleisosom alt RNA, U2 spleisosom alt RNA, U4 spleisosom alt RNA, U5 spleisosom alt RNA og U6 spleisosom alt RNA.
Hva er snoRNA?
Små nukleolært RNA eller snoRNA er en klasse av små RNA-molekyler som styrer kjemiske modifikasjoner i annet RNA som ribosom alt RNA, overførings-RNA og lite nukleært RNA. Hvert snoRNA-molekyl er assosiert med rundt fire kjerneproteiner i RNA/proteinkomplekset under modifikasjonsprosessen. SnoRNA inneholder et antisense-element som er rundt 10-20 nukleotider. Disse basene er komplementære til sekvensen som omgir nukleotidene som målretter modifikasjonen i pre-RNA-molekylet.
Figur 02: Lite nukleolært RNA
Det er to klasser med snoRNA. De er C/D-boks-snoRNA og H/ACA-boks-snoRNA. C/D-boks-snoRNA er assosiert med metylering, og H/ACA-boks-snoRNA er assosiert med pseudo-uridylering. Hvert snoRNA-molekyl fungerer som en guide for en eller to modifikasjoner i et mål-RNA. C/D-boks-snoRNA inneholder to korte bevarte sekvensmotiver C og D, nær henholdsvis 5'- og 3'-enden av snoRNA. Korte regioner bestående av 5 nukleotider arrangeres oppstrøms for C-boksen og nedstrøms for D-boksen og danner en stammeboksstruktur. Dette bringer C- og D-boksmotivene i nærheten. Stamboksstruktur er viktig for korrekt snoRNA-syntese og nukleolær lokalisering. H/ACA box snoRNA har en sekundær struktur som består av to hårnåler og to enkeltstrengede regioner. Dette er ofte kjent som hårnål-hengsel-hårnål-hale-strukturen. H/ACA boks snoRNA består også av to konserverte motiver H og ACA. Begge er lokalisert i enkeltstrengede regioner. H-boksen er i hengslet, og ACA er i haleregionen. Tre nukleotider danner 3’-enden av sekvensen.
Hva er likhetene mellom snRNA og snoRNA?
- snRNA og snoRNA er små RNA.
- Begge finnes i eukaryote celler.
- Begge er ikke-kodende RNA-molekyler.
- Dessuten deltar de i å modifisere RNA under transkripsjonsprosessen.
Hva er forskjellen mellom snRNA og snoRNA?
snRNA deltar i alternativ spleising av pre-mRNA mens snoRNA hovedsakelig modifiserer RNA-molekyler. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom snRNA og snoRNA. Videre er snRNA-er omtrent 150 nukleotider lange og er ofte funnet knyttet til en gruppe proteiner og komplekser k alt små nukleære ribonukleoproteiner. snoRNA-er er omtrent 60-170 nukleotider lange og finnes hovedsakelig i nukleolus.
I tillegg blir snRNA-er transkribert av enten RNA-polymerase II eller RNA-polymerase III, mens snoRNA bare transkriberes av RNA-polymerase II.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom snRNA og snoRNA i tabellform for side ved side sammenligning.
Sammendrag – snRNA vs snoRNA
snRNA og snoRNA er klasser av små RNA-molekyler. snRNA deltar i alternativ spleising av pre-mRNA mens snoRNA hovedsakelig modifiserer RNA-molekyler. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom snRNA og snoRNA. Små RNA er polymere RNA-molekyler som består av mindre enn 200 nukleotider i lengde og er vanligvis ikke-kodende. snRNA finnes i kjernen til eukaryoter. snoRNA finnes i archaea og eukaryoter. Transkripsjon av snRNA skjer gjennom RNA-polymerase II og II, mens kun RNA-polymerase II er involvert i transkribering av snoRNA. Så dette oppsummerer forskjellen mellom snRNA og snoRNA.
