Nøkkelforskjellen mellom N-koblede og O-koblede oligosakkarider er at N-koblede oligosakkarider dannes når N-atomer av proteiner binder seg til et sukker, mens O-koblede oligosakkarider dannes når O-atomer av serin eller treonin binder seg med en sukker.
Oligosakkarider er karbohydratmolekyler som inneholder tre til seks enheter monosakkarider eller enkle sukkerarter. N-koblede oligosakkarider er karbohydratmolekyler der et oligosakkarid er festet til et nitrogenatom. O-koblede oligosakkarider er derimot en type karbohydrater der et sukkermolekyl er festet til et oksygenatom i en serin- eller treoninrest i et protein.
Hva er N-koblede oligosakkarider?
N-koblede oligosakkarider er karbohydratmolekyler hvis oligosakkarider er festet til nitrogenatomer. Dette skjer gjennom prosessen med N-glykosylering. Oligosakkarider er karbohydratforbindelser som inneholder flere sukkermolekyler. Disse kalles noen ganger "glykaner". I prosessen med N-koblet glykosylering kommer nitrogenatomet vanligvis fra amidnitrogenet til en asparaginrest av et protein. Denne prosessen er best beskrevet innen biokjemi.
Vanligvis foregår N-koblet glykosylering i mange eukaryote proteiner. Blant eukaryoter forekommer dette mye i archaea, men sjelden i bakterier. Vi kan bestemme naturen til det N-koblede oligosakkaridet som er festet til et glykoprotein gjennom proteinet og cellen det uttrykkes i. Typen av N-koblet oligosakkarid avhenger også av arten av organismer.
I et glykoprotein er det vanligvis to bindingstyper: bindingen mellom sakkaridrester i glykanet og bindingen mellom glykankjeden og proteinmolekylet. Der er sukkerdeler bundet til hverandre gjennom glykosidbindinger. Glykosidbindingene er typisk C1-C4-bindinger. Dessuten krever bindingen mellom et oligosakkarid og en proteinrest gjenkjennelse av en konsensussekvens.
Hva er O-koblede oligosakkarider?
O-koblede oligosakkarider er en type karbohydrater der et sukkermolekyl er festet til et oksygenatom i en serin- eller treoninrest i et protein. Prosessen med denne bindingsdannelsen er kjent som O-bundet glykosylering. Det er en post-transitional modifikasjonsprosess som finner sted etter syntesen av et protein.
Når man vurderer eukaryoter, skjer denne syntesen i det endoplasmatiske retikulumet, Golgi-apparatet og noen ganger i cytoplasmaet. Hos prokaryoter foregår dette i cytoplasmaet. Det finnes flere forskjellige typer sukkerarter som kan bindes med serin eller treonin. Denne bindingen kan påvirke proteinet på forskjellige måter. f.eks. handel med celler i immunsystemet, som gjør det mulig å gjenkjenne fremmedlegemer.
Hva er forskjellen mellom N-koblede og O-koblede oligosakkarider?
N-koblede oligosakkarider er karbohydratmolekyler der oligosakkaridet er festet til et nitrogenatom, mens O-koblede oligosakkarider er en type karbohydrater hvor et sukkermolekyl er festet til et oksygenatom i en serin- eller treoninrest i en protein. Derfor er den viktigste forskjellen mellom N-koblede og O-koblede oligosakkarider at N-koblede oligosakkarider dannes når N-atomet i proteiner binder seg til et sukker, mens O-koblede oligosakkarider dannes når O-atomer av serin eller treonin binder seg til et sukker.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom N-koblede og O-koblede oligosakkarider i tabellform for sammenligning side ved side.
Sammendrag – N-koblede vs O-koblede oligosakkarider
Oligosakkarider er en type sukkermolekyl. Den viktigste forskjellen mellom N-koblede og O-koblede oligosakkarider er at N-koblede oligosakkarider dannes når N-atomer av proteiner binder seg til et sukker, mens O-koblede oligosakkarider dannes når O-atomer av serin eller treonin binder seg til et sukker.