Nøkkelforskjellen mellom isoschizomerer og neoschizomerer er at isoschizomerer er restriksjonsenzymer som har samme gjenkjennelsessekvens og sp alter DNA i de samme posisjonene, mens neoschizomerer er restriksjonsenzymer som har samme gjenkjennelsessekvens, men som sp alter DNA i forskjellige posisjoner..
Restriksjonsenzymer eller restriksjonsendonukleaser er enzymer som sp alter DNA til fragmenter på eller nær spesifikke gjenkjennelsessteder. De kutter DNA på restriksjonssteder. Restriksjonsenzymer klassifiseres vanligvis i fem grupper basert på struktur, om de kutter DNA-substratet på gjenkjenningsstedet, og om gjenkjennelses- og sp altningsstedene er atskilt fra hverandre. Mer enn 3600 restriksjonsendonukleaser er allerede identifisert. Omtrent 800 restriksjonsenzymer er kommersielt tilgjengelige. Isoschizomerer og neoschizomerer er to typer restriksjonsenzymer basert på gjenkjenningssted og sp altningsspesifisitet.
Hva er isoschizomerer?
Isoschizomerer er restriksjonsenzymer som har samme gjenkjennelsessekvens og sp alter DNA i de samme posisjonene. Disse restriksjonsenzymene har samme spesifisitet. Det første oppdagede restriksjonsenzymet som gjenkjenner en gitt sekvens er kjent som en prototype, mens alle senere identifiserte restriksjonsenzymer som gjenkjenner den samme sekvensen kalles isoschizomerer. Imidlertid kan isoschizomerer variere i stedspreferanser, reaksjonsbetingelser, metyleringsfølsomhet og stjerneaktivitet. Isoschizomerer er isolert fra forskjellige bakteriestammer. Derfor kan de kreve forskjellige reaksjonsbetingelser. I noen tilfeller kan bare én av et par isoschizomerer gjenkjenne både metylerte og umetylerte former for restriksjonssteder. På den annen side kan det andre restriksjonsenzymet bare gjenkjenne den umetylerte formen av restriksjonssetet. Denne spesielle egenskapen til isoschizomerer hjelper til med å identifisere metyleringstilstanden til restriksjonsstedet mens den isoleres fra en bakteriell tilstand.
For eksempel gjenkjenner og sp alter AgeI og BshT1 5'-A↓CCGGT i samme mønster. HpaII og MSPI er andre par av isoschizomerer. De gjenkjenner begge sekvens 5'-C↓CGG-3' når den er umetylert. Men når den andre C-en i sekvensen er metylert, er det bare MSPI som kan gjenkjenne denne sekvensen mens HpaII ikke kan gjenkjenne den.
Hva er neoschizomerer?
Neoschizomerer er restriksjonsenzymer som har samme gjenkjennelsessekvens, men som sp alter DNA i forskjellige posisjoner. I noen spesielle molekylærbiologiske applikasjoner er dette en veldig nyttig funksjon. Neoschizomerene er en undergruppe av isoschizomerer. Velkjente eksempler på neoschizomerer er SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) og XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); begge gjenkjenner 5'-CCCGGG-3'-sekvensen, men sp alter dem i en annen posisjon. Dermed genererer disse to restriksjonsenzymene forskjellige typer ender. I dette tilfellet produserer SmaI butte ender, og XmaI produserer 5' utstående ender.
Figur 01: Neoschizomers
Et annet eksempel er MaeII- og Tail-restriksjonsenzymparet. Prototype MaeII (A↓CGT) produserer DNA-fragmenter med en 2-baser 5'-forlengelse, og neoschizomer Tail (ACGT↓) produserer DNA-fragmenter med en 4-base3'-forlengelse.
Hva er likhetene mellom isoschizomere og neoschizomerer?
- Isoschizomerer og neoschizomerer er to typer restriksjonsenzymer.
- De finnes hovedsakelig i prokaryoter.
- De er en del av restriksjonsmodifikasjonssystemet (RM) som finnes i bakterier og arkea.
- Begge er proteinmolekyler.
- Begge sp alter DNA til fragmenter.
Hva er forskjellen mellom isoschizomere og neoschizomere?
Isoschizomerer er restriksjonsenzymer som har samme gjenkjennelsessekvens og sp alter DNA i samme posisjoner, mens neoschizomerer er restriksjonsenzymer som har samme gjenkjennelsessekvens, men som sp alter DNA i forskjellige posisjoner. Så dette er nøkkelforskjellen mellom isoschizomerer og neoschizomerer. Videre har isoschizomerer de samme spesifisitetene mens neoschizomerer har forskjellige spesifisiteter.
Følgende infografikk viser forskjellene mellom isoschizomerer og neoschizomerer i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – Isoschizomers vs Neoschizomers
Restriksjonsenzymer er DNA-skjærende enzymer. De kalles også molekylære sakser. Det finnes forskjellige typer restriksjonsenzymer. Basert på gjenkjennelsesstedet og sp altningsspesifisiteten, er restriksjonsenzymer to typer som isoschizomerer og neoschizomerer. Isoschizomerer har samme gjenkjennelsessekvens og sp alter DNA i de samme posisjonene mens neoschizomerer har samme gjenkjennelsessekvens, men sp alter DNA i forskjellige posisjoner. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom isoschizomerer og neoschizomerer.
