Polypeptid vs Protein
Aminosyre er et enkelt molekyl dannet med C, H, O, N og kan være S. Den har følgende generelle struktur.
Det er omtrent 20 vanlige aminosyrer. Alle aminosyrene har en –COOH, -NH2 grupper og en –H bundet til et karbon. Karbonet er et kir alt karbon, og alfa-aminosyrer er de viktigste i den biologiske verden. R-gruppen er forskjellig fra aminosyre til aminosyre. Den enkleste aminosyren der R-gruppen er H er glycin. I henhold til R-gruppen kan aminosyrer kategoriseres i alifatiske, aromatiske, ikke-polare, polare, positivt ladede, negativt ladede eller polare uladede, etc. Aminosyrer tilstede som zwitterioner i den fysiologiske pH 7,4. Aminosyrer er byggesteinene i proteiner. Når to aminosyrer går sammen for å danne et dipeptid, skjer kombinasjonen i en -NH2 gruppe av én aminosyre med –COOH-gruppen til en annen aminosyre. Et vannmolekyl fjernes, og den dannede bindingen er kjent som en peptidbinding.
polypeptid
Kjeden dannes når et stort antall aminosyrer kobles sammen er kjent som et polypeptid. Proteiner består av en eller flere av disse polypeptidkjedene. Den primære strukturen til et protein er kjent som et polypeptid. Fra de to terminalene av polypeptidkjeden er N-terminalen der aminogruppen er fri, og c-terminalen er der karboksylgruppen er fri. Polypeptider syntetiseres ved ribosomer. Aminosyresekvensen i polypeptidkjeden bestemmes av kodonene i mRNA.
Protein
Proteiner er en av de viktigste typene makromolekyler i levende organismer. Proteiner kan kategoriseres som primære, sekundære, tertiære og kvaternære proteiner avhengig av deres strukturer. Sekvensen av aminosyrer (polypeptid) i et protein kalles en primær struktur. Når polypeptidstrukturer foldes inn i tilfeldige arrangementer, er de kjent som sekundære proteiner. I tertiære strukturer har proteiner en tredimensjonal struktur. Når få tredimensjonale proteindeler bindes sammen, danner de kvartære proteiner. Den tredimensjonale strukturen til proteiner avhenger av hydrogenbindinger, disulfidbindinger, ioniske bindinger, hydrofobe interaksjoner og alle de andre intermolekylære interaksjonene innenfor aminosyrer. Proteiner spiller flere roller i levende systemer. De deltar i å danne strukturer. For eksempel har muskler proteinfibre som kollagen og elastin. De finnes også i harde og stive strukturelle deler som negler, hår, hover, fjær osv. Ytterligere proteiner finnes i bindevev som brusk. Bortsett fra den strukturelle funksjonen, har proteiner også en beskyttende funksjon. Antistoffer er proteiner, og de beskytter kroppen mot fremmede infeksjoner. Alle enzymene er proteiner. Enzymer er hovedmolekylene som kontrollerer alle metabolske aktiviteter. Videre deltar proteiner i cellesignalering. Proteiner produseres på ribosomer. Proteinproduserende signal sendes til ribosomet fra genene i DNA. De nødvendige aminosyrene kan komme fra kosten eller kan syntetiseres inne i cellen. Proteindenaturering resulterer i utfoldelse og desorganisering av proteinenes sekundære og tertiære strukturer. Dette kan skyldes varme, organiske løsemidler, sterke syrer og baser, vaskemidler, mekaniske krefter osv.
Hva er forskjellen mellom polypeptid og protein?
• Polypeptider er aminosyresekvenser, mens proteiner er laget av en eller flere polypeptidkjeder.
• Proteiner har høyere molekylvekt enn polypeptider.
• Proteiner har hydrogenbindinger, disulfidbindinger og andre elektrostatiske interaksjoner, som styrer dens tredimensjonale struktur i motsetning til polypeptider.