Nøkkelforskjellen mellom oligopeptid og polypeptid er at oligopeptider inneholder få aminosyrerester, mens polypeptider inneholder et stort antall aminosyrerester.
Begrepene oligopeptider og polypeptider kommer inn under kategorien proteiner. Peptider er korte kjeder av aminosyrer. Aminosyrer binder seg til hverandre gjennom peptidbindinger. Derfor kan vi kategorisere disse peptidene i henhold til antall aminosyrer som er tilstede i disse peptidene. For eksempel dipeptider, tripeptider, tetrapeptider, oligopeptider og polypeptider.
Hva er oligopeptid?
Et oligopeptid er en kjede av aminosyrer som inneholder et lite antall aminosyrer per molekyl. Vi kaller ofte disse molekylene "peptider", som et generelt begrep. Antallet aminosyrerester tilstede i disse peptidmolekylene kan variere fra to til tjue aminosyrer. Oligopeptider kan også inkludere noen små peptidformer som dipeptider, tripeptider osv. Noen vanlige eksempler på naturlig forekommende oligopeptider inkluderer mikroviridin, cyanopeptoliner, mikrocystiner osv.
Figur 01: Structure of a Tripeptide
Disse oligopeptidene produseres av ikke-ribosomale peptidsyntaser eller NRPS. Men det er noen unntak. For eksempel syntetiseres cyklamider og mikroviridin gjennom ribosomiske veier. Prosessen med isolering av oligopeptider inkluderer oligopeptidanrikning, rensing og identifikasjon. For identifiseringsprosessen kan vi bruke gelkromatografi, HPLC, HPLC-massespektroskopi, ionebytterkromatografi, etc.
Hva er polypeptid
Et polypeptid er en kjede av aminosyrerester som inneholder et stort antall aminosyrer. Et protein inneholder en eller flere polypeptidkjeder. I disse polypeptidkjedene er aminosyrene knyttet til hverandre via peptidbindinger, som er en type kovalente kjemiske bindinger. Hver polypeptidkjede inneholder to terminaler: N-terminal og C-terminal. N-terminalen er aminoterminalen, som ender med en fri aminogruppe, mens C-terminalen er karboksylterminalen som ender med en fri karboksylgruppe. Sekvensen av aminosyrer som er tilstede i et peptid bestemmes av kodonene i mRNA som er involvert i produksjonen av polypeptidet eller proteinet via translasjon av malstrengen.
I henhold til antallet og arrangementet av polypeptider i et protein, er det fire hovedtyper av proteinstrukturer som følger:
- Primærstruktur – Den primære strukturen til et protein inneholder en enkelt polypeptidkjede som har disulfidbroer mellom noen aminosyrer i samme kjede, som danner en foldet struktur.
- Sekundær struktur – Den sekundære strukturen til et protein har to hovedformer: alfa-helix-struktur og beta-sheet-struktur.
Figur 02: Alpha Helix Structure
- Tertiær struktur – Dette er en svært sammenfoldet nettverksstruktur. Denne strukturen er veldig viktig fordi den bestemmer funksjonen til et protein.
- Kvaternær struktur – Dette er en svært kompleks struktur av to eller tre polypeptidkjeder som er koblet til hverandre.
Hva er forskjellen mellom oligopeptid og polypeptid?
Oligopeptider og polypeptider er to forskjellige kategorier av proteiner. De skiller seg fra hverandre avhengig av antall aminosyrerester som er tilstede i proteinmolekylene. Derfor er nøkkelforskjellen mellom oligopeptid og polypeptid at oligopeptidene inneholder få aminosyrerester, mens polypeptider inneholder et stort antall aminosyrerester.
Infografikken nedenfor oppsummerer forskjellen mellom oligopeptid og polypeptid.
Summary – Oligopeptide vs. Polypeptide
Oligopeptider og polypeptider er to forskjellige kategorier av proteiner. De skiller seg fra hverandre, avhengig av antall aminosyrerester som er tilstede i disse proteinmolekylene. Det vil si at hovedforskjellen mellom oligopeptid og polypeptid er at oligopeptider inneholder få aminosyrerester, mens polypeptider inneholder et stort antall aminosyrerester.