Nøkkelforskjellen mellom motiv og domene er at motivet ikke er uavhengig stabilt mens domenet er uavhengig stabilt.
Proteiner er viktige biologiske makromolekyler som finnes i kroppen vår. På den annen side vil den genetiske koden til et gen bestemme aminosyresekvensen til et protein. Dessuten har proteiner primære, sekundære og tertiære strukturer. Den primære strukturen er aminosyresekvensen til polypeptidkjeden. Når polypeptidkjeder foldes med hverandre, danner det den sekundære strukturen til proteinet. Alfa-helikser, beta-ark og super-sekundære strukturer tilhører de sekundære strukturene. Visse grupperinger av supersekundære elementer er kjent som proteinmotiver. Den tertiære strukturen til et protein refererer til dets tredimensjonale struktur som bestemmer funksjonen til proteinet. Domene er en foldet del av et proteinmolekyl, som er kuleformet og har en diskret funksjon. Det er den grunnleggende funksjonelle og tredimensjonale strukturen til proteinet.
Hva er motiv?
Motif er en viss gruppering av de supersekundære elementene i proteiner som alfahelikser og betastrukturer. De er en slags mønstre som finnes i forskjellige proteiner. Motiver beskriver foldemønstrene til de sekundære strukturelle elementene og deres interaksjoner. Disse brettemønstrene stabiliseres ved lignende koblinger som er tilstede i tertiære strukturer. De er imidlertid ikke så komplekse som tertiære strukturer.
Figur 01: Motiv
De er enkle kombinasjoner av sekundære strukturer av proteiner. Motivet er ikke stabilt i seg selv. Videre forklarer motiver strukturen til et protein, men forutsier ikke funksjonen til et protein. Eksempler på proteinmotiver er et beta-alfa-beta-motiv, gresk nøkkelmotiv, Beta-tønne, Beta-meander-motiv osv.
Hva er domene?
Domene er en grunnleggende, funksjonell og tredimensjonal enhet av et protein. Den utfører en bestemt funksjon. Et enkelt protein kan ha flere forskjellige domener. Hvert domene er en uavhengig enhet. Det er en kuleformet struktur. Den er ansvarlig for en spesifikk funksjon eller interaksjon. Domener kan brukes til å gi hypoteser om funksjonen til et ukarakterisert protein. Når man analyserer et protein, er det viktig å ta hensyn til siden domener er de funksjonelle enhetene til proteinet.
Figur 02: Tre forskjellige domener av Pyruvate Kinase
Domener er veldig stabile og kompakte strukturer. De kan lett skilles fra andre regioner. Pyruvatkinase har tre forskjellige domener som vist i figur 02. Lengden på domenet kan variere, og gjennomsnittslengden er 100 aminosyrer. Hvert domene inneholder en hydrofob kjerne bygget av sekundære strukturelle enheter. Flere domener utgjør til sammen den tertiære strukturen til et protein.
Hva er likhetene mellom motiv og domene?
- Motiv og domene er enheter som finnes i selve proteinmolekylene.
- De er nyttige når man klassifiserer proteinfamilier.
Hva er forskjellen mellom motiv og domene?
Motif er en viss gruppering av de supersekundære elementene i proteiner som alfahelikser og betastrukturer mens domene er den funksjonelle enheten til et protein. Videre er motiv en sekundær struktur mens domene er ansvarlig for den tertiære strukturen til proteinet. Dessuten er domene en uavhengig enhet, i motsetning til et motiv. Domene skildrer også funksjonen til et protein mens motiv ikke er det. Dette er hovedforskjellene mellom motiv og domene. Infografikken nedenfor viser forskjellen mellom motiv og domene i tabellform.
Summary – Motiv vs Domain
Motif er et arrangement av sekundære strukturer til proteinmolekylet. Det er vanligvis ikke stabilt i seg selv, i motsetning til et domene. Domene er en uavhengig stabil struktur av et protein. Derfor kan det være et helt eller delvis proteinmolekyl. Det er en tredimensjonal grunnleggende funksjonell enhet av proteinet. Dessuten har den en funksjon, og den er en uavhengig enhet. Motiv kan være en del av domenet. Men domene kan ikke være en del av et motiv. Dette er forskjellen mellom motiv og domene.
