Nøkkelforskjellen mellom proteinunderenhet og domene er at en proteinunderenhet er en separat polypeptidkjede av et protein som settes sammen med andre polypeptidkjeder for å danne et proteinkompleks, mens et proteindomene er en sammenhengende region av polypeptidkjeden av et protein som ofte foldes uavhengig til en kompakt, lokal og semi-uavhengig enhet.
Proteinunderenhet og domene er svært viktige deler av et multimert protein. Proteiner er polymerer laget av polypeptider. Hver polypeptidkjede bygges opp fra en monomer kjent som en aminosyre. Et komplekst protein inneholder distinkte strukturelle enheter som underenheter, domener, motiv og fold. Disse strukturelle enhetene til et komplekst protein er ekstremt viktige for dets struktur og til syvende og sist for dets funksjon.
Hva er en proteinunderenhet?
En proteinunderenhet er en separat polypeptidkjede av et protein som settes sammen med andre polypeptidkjeder for å danne et proteinkompleks. I strukturell biologi er en proteinunderenhet et enkelt proteinmolekyl som settes sammen med andre proteinmolekyler for å danne et proteinkompleks. Naturlig forekommende proteiner har et relativt lite antall underenheter, slik som hemoglobin og DNA-polymerase. Derfor kalles de oligomere. Andre proteiner består av et stort antall underenheter, så de beskrives som multimere. For eksempel er mikrotubuli og andre cytoskjelettproteiner multimere. Underenhetene til multimert protein kan være identiske (homologe) eller tot alt forskjellige (heterologe).
Figur 01: Proteinunderenhet
I noen multimere proteiner kan én underenhet være en katalytisk underenhet. På den annen side er den andre en regulatorisk underenhet. Funksjonen til den katalytiske underenheten er å katalysere den enzymatiske reaksjonen, mens funksjonen til den regulatoriske underenheten letter eller hemmer dens aktivitet. Et enzym som består av både katalytiske og regulatoriske underenheter når det er satt sammen, refereres vanligvis til som et holoenzym. For eksempel har enzymklasse I fosfoinositid 3-kinase en p110 katalytisk underenhet og en p85 regulatorisk underenhet. Dessuten må et protein ha ett gen for hver underenhet. Dette er fordi en underenhet består av en separat polypeptidkjede som har ett kodende gen.
Hva er et proteindomene?
Et proteindomene er en sammenhengende region av polypeptidkjeden til et protein som ofte foldes uavhengig til en kompakt, lokal og semi-uavhengig enhet. Domenet til et protein er også kjent som en region av polypeptidkjeden av protein som er selvstabiliserende og folder seg uavhengig av resten. De er en distinkt strukturell og funksjonell enhet i et protein. Norm alt er domener ansvarlige for en spesifikk funksjon eller en interaksjon som bidrar til proteinets overordnede rolle. For eksempel er SH3-domenet rundt 50 aminosyrerester. De forekommer i et mangfoldig utvalg av proteiner, inkludert adapterproteiner, fosfatidylinositol3-kinaser, fosfolipaser og myosiner. Disse SH3-domenene er involvert i protein-protein-interaksjoner.
Figur 02: Proteindomener
Domenene varierer i lengde fra 50 aminosyrer til 250 aminosyrer. De korteste domenene, som sinkfinger, stabiliseres av metallioner og disulfidbroer. Et domene produserer ofte funksjonelle enheter som det kalsiumbindende EF-hånddomenet til calmodulin. Videre kan domener byttes gjennom genteknologi mellom ett protein til et annet for å lage kimære proteiner.
Hva er likhetene mellom proteinunderenhet og domene?
- Proteinunderenhet og domene er strukturelle enheter av et multimert protein.
- Begge består av aminosyrer.
- De er knyttet til begrepet "polypeptidkjede".
- Dessuten er de begge ekstremt viktige for den generelle funksjonen til proteinet.
Hva er forskjellen mellom proteinunderenhet og domene?
En proteinunderenhet er en separat polypeptidkjede av et protein som settes sammen med andre polypeptidkjeder for å danne et proteinkompleks. På den annen side er et proteindomene en sammenhengende region av polypeptidkjeden til et protein som ofte folder seg uavhengig til en kompakt, lokal og semi-uavhengig enhet. Så dette er nøkkelforskjellen mellom proteinunderenhet og domene. Dessuten er en proteinunderenhet større enn et proteindomene.
Den følgende tabellen oppsummerer forskjellen mellom proteinunderenhet og domene i tabellform.
Summary – Protein Subunit vs Domain
Byggesteinene til proteiner er aminosyrer. Proteiner dannes ved kondensering av aminosyrer. Proteinstrukturer varierer i størrelse fra titalls til flere tusen aminosyrer. En proteinstruktur stabiliseres av ikke-kovalente interaksjoner som hydrogenbindinger, ioniske bindinger, Van der Waals-krefter, hydrofobe bindinger og kovalente interaksjoner som disulfidbindinger. Et komplekst protein inneholder distinkte strukturelle enheter som underenheter, domener, motiv og fold. En proteinunderenhet er en separat polypeptidkjede av et protein som settes sammen med andre polypeptidkjeder for å danne et proteinkompleks. På den annen side er proteindomenet en region av polypeptidkjeden av protein som er selvstabiliserende og folder seg uavhengig av resten. Dermed er dette sammendraget av forskjellen mellom proteinunderenhet og domene.
