Nøkkelforskjellen mellom VNTR og sonde er at VNTR er en kort nukleotidsekvens som forekommer som en tandem-repetisjon i genomet, mens en sonde er en kunstig syntetisert kort sekvens av DNA eller RNA som kan merkes radioaktivt.
VNTR står for variabel nummer tandem repeat. Det er en kort nukleotidsekvens organisert i tandem-repetisjoner i genomet. VNTR-er forekommer naturlig i genomet vårt. En sonde er en kunstig syntetisert kort DNA- eller RNA-sekvens. Både probe og VNTR er nukleinsyrer eller korte nukleotidsekvenser. De har enorm bruk i forskjellige molekylærbiologiske teknikker, hovedsakelig i rettsmedisinske studier. VNTR og sonde deler noen likheter så vel som forskjeller. Derfor forsøker artikkelen å fremheve forskjellen mellom VNTR og sonde.
Hva er en VNTR?
VNTR er en kort nukleotidsekvens som eksisterer som en tandem-repetisjon i genomet vårt. VNTR-er er tilstede i mange kromosomer. Videre skiller VNTR-er mellom forskjellige individer fra lengdene siden antall repetisjoner er forskjellig i VNTR-er til forskjellige personer. I utgangspunktet er det på grunn av alleler som er arvet fra foreldrene deres. Derfor bruker vi hovedsakelig VNTR-er for foreldreidentifikasjon (arv) eller til personlige formål. På samme måte er det også mulig å bruke dem i genetikk, rettsmedisin, biologisk forskning og DNA-fingeravtrykk. Derfor er VNTR et viktig verktøy innen molekylærbiologi.
Figur 01: VNTR
I arv analyserer vi VNTR-data ved å bruke to grunnleggende prinsipper: arvematching og identitetsmatching. Under arvematching må individet ha en matchende allel til hver forelder. Under identitetsmatching må begge VNTR-allelene være tilstede på en bestemt plassering av genomet.
Hva er en sonde?
I sammenheng med molekylærbiologi er en sonde et kunstig syntetisert DNA- eller RNA-fragment med en lengde på 100 til 1000 baser. Vi kan radioaktivt merke disse sonder. Derfor bruker vi dem til å oppdage målnukleotidsekvenser som er komplementære til sekvensen til proben. Når vi legger prober til prøven, skjer hybridisering med de komplementære sekvensene eller målsekvensene og gjør det enkelt for oss å identifisere målsekvensene. Siden sonder har radioaktivitet, kan vi enkelt oppdage dem.
Figur 02: Probe
I rettsmedisinsk vitenskap bruker vi ofte prober i DNA-profileringsteknikker som påvisning av korte tandem-repetisjonsregioner, restriksjonsfragmentlengdepolymorfismer og DNA-fingeravtrykk.
Hva er likhetene mellom VNTR og sonde?
- Nukleinsyrer er byggesteinene i VNTR og Probe.
- Vi bruker dem i genidentifikasjonsprosesser.
- I tillegg er begge lengdene variable.
- De er viktige verktøy i rettsmedisinske studier, DNA-fingeravtrykk, genetikk osv.
Hva er forskjellen mellom VNTR og sonde?
VNTR er en region av genomet organisert som tandem-repetisjoner mens en probe er en kort DNA- eller RNA-sekvens syntetisert kunstig for å oppdage målsekvenser i en prøve. Så dette er nøkkelforskjellen mellom VNTR og sonde. En viktig forskjell mellom VNTR og sonde er også at i motsetning til VNTR-er, kan vi radioaktivt merke probene.
Dessuten utfører VNTR-er stort sett foreldreidentifikasjoner, mens prober hjelper til med å oppdage målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prøver som er komplementære til sekvensen til sonden. Derfor er dette også en betydelig forskjell mellom VNTR og sonde.
Følgende infografikk gir mer informasjon om forskjellen mellom VNTR og sonde.
Sammendrag – VNTR vs Probe
Vanlig bruk av VNTR og sonde er i molekylære analyseteknikker som rettsmedisinske studier og DNA-fingeravtrykk. Begge består av variable lengder. Imidlertid er nøkkelforskjellen mellom VNTR og probe at en VNTR er en region av genomet arrangert med tandem-repetisjoner mens en probe er et fragment av DNA eller RNA som kan merkes radioaktivt. Dessuten er VNTR-er tilstede i genomet. Men prober er kunstig syntetisert og kan merkes radioaktivt for å oppdage målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prøver som er komplementære til sekvensen i proben. Dermed er dette sammendraget av forskjellen mellom VNTR og sonde.
