Nøkkelforskjellen mellom proteomikk og metabolomikk er at proteomikk er studiet av alle proteiner i en organisme mens metabolomikk er studiet av alle metabolitter av en organisme.
Genomics er studiet av den genetiske sammensetningen til en organisme. Proteomikk og metabolomikk er to omiske vitenskaper relatert til genomikk. Proteom refererer til alle proteiner i en celle eller en organisme. Metabolom, derimot, refererer til alle metabolitter av en organisme. Dermed er studiet av proteomet proteomikken mens studiet av metabolomet er metabolomikken. Både proteomikk og metabolomikk er viktige i sykdomsdiagnostikk og i karakterisering og screening av organismer. Dessuten henger begge sammen i mange aspekter av cellebiologi, spesielt innen cellesignalering, proteinnedbrytning og generering og post-translasjonell modifikasjon.
Hva er proteomikk?
Proteome er det totale proteinkomplementet i en celle, vev eller en organisme. Derfor er proteomikk studiet av proteomet til en organisme. I proteomikk analyseres ulike egenskaper ved proteiner. Derfor fokuserer proteomikk hovedsakelig på struktur, orientering, funksjoner, proteininteraksjoner, modifikasjoner, applikasjoner og viktigheten av proteiner. Det er derfor det gjennomføres mange forskningsprosjekter innen proteomikk i dag.
De første proteomiske studiene ble gjort for å identifisere proteininnholdet i Escherichia coli. Kartleggingen av det totale proteininnholdet ble gjort ved å bruke todimensjonale (2D) geler. Etter suksessen med dette prosjektet gikk forskerne videre til å karakterisere det totale proteininnholdet i dyr som marsvin og mus. For tiden gjøres kartlegging av menneskelig protein ved å bruke 2D gelelektroforese.
Det er mange fordeler med å studere proteomikk ettersom proteiner er de styrende molekylene for mest aktivitet på grunn av proteiners katalysatoregenskap. Dermed kan studiet av hele proteiner gi informasjon om helsetilstanden til en organisme. Dessuten har proteomikk mange anvendelser innen genomkommentarer, sykdomsidentifikasjon og diagnostikk, gjennomføring av proteinekspresjonsstudier under eksperimentering og proteinmodifikasjoner og interaksjonsstudier, etc.
Figur 01: Proteomics
Det er ulike teknikker involvert i proteomikk, inkludert ekstraksjon av det totale proteinet, separering av dem ved hjelp av 2D gelelektroforese, sekvensering av de ekstraherte proteinene ved bruk av metoder som Edmunds sekvenseringsmetode eller massespektrometri og analyse av strukturell og funksjonell egenskaper til proteinet ved hjelp av datamaskinbasert programvare og bioinformatikkverktøy.
Hva er Metabolomics?
Metabolomics er studiet av alle metabolitter i en celle, vev eller en organisme. Det inkluderer identifisering og kvantifisering av cellulære metabolitter ved hjelp av forskjellige avanserte analytiske og statistiske verktøy. Metabolomics er en viktig studie siden den avslører informasjon om metabolismen til en organisme.
Figur 02: Metabolomics
For å studere substrater og produkter av metabolske reaksjoner, bruker metabolomics massespektrometri som en analytisk plattform. Massespektrometri resulterer i metabolitter og deres konsentrasjoner, som gjenspeiler den faktiske biokjemiske tilstanden til cellene eller vevene. Derfor kan metabolomikk betraktes som den beste representasjonen av den molekylære fenotypen til en organisme. I tillegg til disse kan metabolomikk betraktes som en utvidelse av proteomikk fordi de fleste metabolitter genereres på grunn av aktivitetene til enzymer som er proteiner.
Hva er likhetene mellom Proteomics og Metabolomics?
- Proteomikk og metabolomikk er to omiske vitenskaper relatert til genomikk.
- Metabolomics kan betraktes som en utvidelse av proteomics.
- Proteom og metabolom er tett sammenvevd med mange studier.
Hva er forskjellen mellom Proteomics og Metabolomics?
Proteomics er en storstilt studie av proteiner inkludert deres struktur og funksjon, i en celle eller en organisme. I mellomtiden er metabolomikk studiet av metabolittprofiler i en celle, vev eller organisme under et gitt sett med forhold. Så dette er nøkkelforskjellen mellom proteomikk og metabolomikk. Dessuten angår proteomikk hovedsakelig det komplette settet med proteiner, mens metabolomikk hovedsakelig angår det komplette settet av metabolitter, inkludert et mangfoldig utvalg av små molekyler som peptider, karbohydrater, lipider, nukleosider og katabolske produkter av eksogene forbindelser, etc. Derfor er dette enda en forskjell mellom proteomikk og metabolomikk.
Infografikken nedenfor oppsummerer forskjellen mellom proteomikk og metabolomikk.
Sammendrag – Proteomics vs Metabolomics
Levende organismer kan studeres ved hjelp av deres genom, proteiner og metabolitter. Genomikk, proteomikk og metabolomikk er de tre områdene som studerer genetisk sammensetning, proteiner og metabolitter til henholdsvis en celle eller en organisme. Proteomikk er viktig siden det er en dynamisk refleksjon av både gener og miljø. Metabolomikk er veldig viktig siden det direkte gjenspeiler den nåværende statusen til den biokjemiske reaksjonen til cellene eller metabolsk status til en organisme. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom proteomikk og metabolomikk.
