Nøkkelforskjellen mellom gruppe I- og gruppe II-introner er at i gruppe I-introner initieres spleisereaksjonen av en guanosin-kofaktor, mens i gruppe II-introner initieres spleisereaksjonen av intern adenosin.
Pre-mRNA er det primære transkriptet som har både introner og eksoner. Pre-mRNA bør konverteres til mRNA før translasjon. RNA-spleising eller pre-mRNA-spleising er en slik post-transkripsjonell modifikasjon. Ved RNA-spleising fjernes introner fra pre-mRNA-molekylet, og eksoner kobles sammen. Gruppe I og gruppe II introner er selvspleisende introner. De spleiser av fra pre-mRNA-molekylet uten hjelp av noe annet enzym. Derfor er de RNA-enzymer eller ribozymer som katalyserer sin egen spleising fra pre-mRNA. Dessuten har de muligheten til å fungere som mobile elementer. Under spleisingen finner en rekke trans-esterifiseringsreaksjoner sted for å fjerne intronet og ligere eksonene. Disse ribozymene er tilstede i alle tre domenene, inkludert bakterier, archaea og eukaryoter.
Hva er gruppe I-introner?
Gruppe I-introner er en type selvspleisende ribozymer som finnes i bakterier, bakteriofager og eukaryoter (organelle og nukleære genomer). De finnes i essensielle gener. De er i stand til å katalysere sin egen spleising fra pre-mRNA-molekylet. Gruppe I-introner kan ha noen hundre til tre tusen nukleotider. Dessuten viser de liten sekvenslikhet på tvers av organismer.
Figur 01: Group I Introns
De sekundære strukturene er svært bevarte i fire korte regioner. Det er to transesterifiseringsreaksjonstrinn for skjøting. Gruppe I-introner initierer skjøtemekanismer ved det nukleofile angrepet av 3'-hydroksylen til en guanosin-kofaktor ved 5P-spleisestedet.
Hva er gruppe II-introner?
Gruppe II-introner er en type selvspleisende introner som finnes i organismer som tilhører alle tre domenene. De er ribozymer som katalyserer sine egne spleisereaksjoner fra pre-mRNA. De finnes i rRNA, tRNA og proteinkodende gener. Men de finnes ikke i kjernefysiske genomer, i motsetning til gruppe I-introner.
Figur 02: Group II Introns
Gruppe II-introner katalyserer spleising via to transesterifiseringstrinn som ligner på gruppe I-introner. Disse enzymene initierer spleisereaksjonen ved det nukleofile angrepet av 2′ OH av grenstedet adenosin på 5′ skjøteforbindelsen. Under spleisereaksjoner danner gruppe II-introner en lariat-lignende struktur. Dessuten finner intronspleising sted i fravær av GTP.
Hva er likhetene mellom gruppe I- og gruppe II-introner?
- Gruppe I- og gruppe II-introner er to typer RNA-enzymer, ribozymer som katalyserer sin egen spleising ved forskjellige mekanismer.
- De er store ribozymer.
- Begge finnes i alle tre domenene.
- De er mobile elementer.
- Dessuten finnes de i rRNA, tRNA og proteinkodende gener.
- Begge enzymer bruker som verktøy innen bioteknologi og molekylær medisin for målrettet gen-knock-out/knock-down, genlevering eller genterapisystemer.
Hva er forskjellen mellom gruppe I- og gruppe II-introner?
Gruppe I-introner er ribozymer som finnes i bakterier, bakteriofager og eukaryote organelle og nukleære genomer. Gruppe II-introner er ribozymer som finnes i bakterier, archaea og eukaryote organeller. Videre initierer gruppe I-intronene spleisereaksjon ved det nukleofile angrepet av 3'-hydroksylet til en guanosin-kofaktor på 5P-spleisestedet, mens gruppe II-introner initierer spleisereaksjonen ved det nukleofile angrepet av 2'OH-en til grenstedets adenosin på 5′ skjøtekryss. Så dette er hovedforskjellen mellom gruppe I- og gruppe II-introner.
Videre danner gruppe II-introner en lariatlignende struktur under skjøtingen mens gruppe I-introner ikke dannes. Dermed er dette en annen signifikant forskjell mellom gruppe I og gruppe II introner. Dessuten finnes gruppe I-intronene i eukaryote kjernegenom, mens gruppe II-introner ikke finnes i eukaryote kjernegenom.
Infografikken nedenfor viser forskjellene mellom gruppe I- og gruppe II-introner i tabellform for sammenligning side ved side.
Sammendrag – Gruppe I vs Gruppe II Introns
Gruppe I og II introner er store ribozymer som katalyserer en transesterifiseringsreaksjon for å spleise ut introner fra det primære transkripsjonen. De finnes i alle tre domenene. De er begge mobile genetiske elementer. Dessuten brukes de som verktøy innen bioteknologi og molekylær medisin. Imidlertid initierer gruppe I-intronene spleisereaksjon ved det nukleofile angrepet av 3' OH til en guanosin-kofaktor ved 5P-spleisestedet. Men gruppe II-intronene initierer spleisereaksjon ved det nukleofile angrepet av 2′ OH til grenstedets adenosin på 5′ skjøteforbindelsen. Videre danner gruppe II-introner en lariatlignende struktur under skjøtingen mens gruppe I-introner ikke danner en lariatlignende struktur. Dermed er dette sammendraget av forskjellen mellom gruppe I- og gruppe II-introner.
