Nøkkelforskjellen mellom EcoRI og HindIII restriksjonsenzymer er at EcoRI er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra E. coli, mens HindIII er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra Haemophilus influenza.
Restriksjonsenzym eller restriksjonsendonuklease er et enzym som sp alter DNA til fragmenter på spesifikke gjenkjennelsessteder (restriksjonssteder) i DNA-molekylet. Disse restriksjonsenzymene finnes i bakterier og archaea. De gir en forsvarsmekanisme mot invaderende virus. Restriksjonsenzymer er generelt klassifisert i fem forskjellige typer: type I, type II, type III, IV og type V. EcoRI og HindIII er to restriksjonsenzymer som tilhører gruppen av type II restriksjonsenzymer.
Hva er EcoRI-restriksjonsenzymer?
EcoRI er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra E.coli-arter. Det er et restriksjonsenzym som sp alter DNA-doble helixer til fragmenter på spesifikke steder. EcoRI er også en del av restriksjonsmodifikasjonssystemet. EcoRI var det første enzymet som opprinnelig ble isolert fra RY13-stammen av E. coli-arten. Det brukes som et restriksjonsenzym i molekylærbiologi. EcoRI lager 4 klebrige nukleotidender med 5'-endeoverheng av AATT. EcoRI kutter DNA ved den spesifikke gjenkjennelsessekvensen G↓AATTC. Den har den palindromiske komplementære sekvensen til CTTAA↓G. Dessuten tilhører dette restriksjonsenzymet type II P (palindromisk spesifisitet) underklassen. I sin primære struktur inneholder EcoRI PD. D/EXK-motivet på det aktive stedet, som mange andre restriksjonsenzymer.
Figur 01: EcoRI
EcoRI restriksjonsenzym er en homodimer på 31 kDa. Den inneholder ett globulært domene av α/β-arkitekturen. Hver underenhet inneholder en løkke som stikker ut fra det kuleformede domenet og vikler seg rundt DNA når det er bundet. Dette enzymet kan kokrystalliseres med sekvensen det vanligvis kutter. Videre brukes EcoRI-restriksjonsenzymet i en lang rekke molekylærgenetiske teknikker, inkludert kloning, DNA-screening og delesjonsseksjoner av DNA in vitro-tilstander.
Hva er HindIII-restriksjonsenzymer?
HindIII er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra Haemophilus influenza-arter. Den sp alter den palindromiske DNA-sekvensen AACCTT i nærvær av kofaktoren Mg2+ gjennom hydrolyse. Sp altningen av denne spesielle sekvensen mellom AA'S (5'A↓ACCTT3' og 3'TTCGA↓A5') resulterer i 5' overheng på DNA-molekylet k alt klebrige ender. Dette enzymet finnes i prokaryote organismer som bakterier. Bakterier bruker dette enzymet som en forsvarsmekanisme mot virus som bakteriofager.
Figur 02: HindIII
Strukturelt sett er HindIII en homodimer. Den inneholder en felles strukturell kjerne som består av fire β-ark og en enkelt α-spiral, som andre typer II-restriksjonsenzymer. Molekylmassen til dette enzymet er 34,9 kDa. Dessuten er HindIII svært nyttig i moderne molekylærbiologiske eksperimenter som DNA-sekvensering og kartlegging.
Hva er likhetene mellom EcoRI- og HindIII-restriksjonsenzymer?
- EcoRI og HindIII er to restriksjonsenzymer som tilhører type II restriksjonsenzymgruppen.
- EcoRI og HindIII ble funnet på begynnelsen av 1970-tallet.
- EcoRI og HindIII inneholder begge PD.. D/EXK-aminosyresekvensmotivet.
- Begge restriksjonsenzymer utfører svært spesifikk sp altning av DNA.
- Disse restriksjonsenzymene trenger Mg2+ som en kofaktor for deres spesifikke aktivitet.
- De produserer klebrige ender etter å ha kuttet DNA.
- De er svært nyttige komponenter i moderne molekylærbiologisk forskning.
Hva er forskjellen mellom EcoRI- og HindIII-restriksjonsenzymer?
EcoRI er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra E.coli arter, mens HindIII er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra Haemophilus influenza arter. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom EcoRI og HindIII. Videre kutter EcoRI DNA ved den spesifikke gjenkjennelsessekvensen G↓AATTC, mens HindIII kutter DNA ved den spesifikke gjenkjennelsessekvensen A↓ACCTT.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom EcoRI og HindIII i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – EcoRI vs HindIII-restriksjonsenzymer
EcoRI og HindIII er to restriksjonsenzymer som tilhører type II p-underklassen. De utfører veldig spesifikk sp alting av DNA. EcoRI er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra E.coli arter, mens HindIII er et type II restriksjonsenzym som er isolert fra Haemophilus influenza arter. Så dette oppsummerer forskjellen mellom EcoRI og HindIII.
