Nøkkelforskjellen mellom sigma-faktor og rho-faktor er at sigma-faktor er et protein som trengs for initiering av transkripsjon i bakterier, mens rho-faktor er et protein som er nødvendig for terminering av transkripsjon i bakterier.
Sigma-faktor og rho-faktor er to viktige faktorer for bakteriell transkripsjon. Bakteriell transkripsjon er en prosess der et stykke bakteriell DNA kopieres inn i en nylaget mRNA-streng (messenger-RNA). Denne prosessen katalyseres av et enzym kjent som RNA-polymerase. Bakterier er sterkt avhengige av transkripsjon og oversettelse for å reagere på miljøet på riktig måte. Den bakterielle RNA-polymerasen består av en kjerne og en holoenzymstruktur. Kjernen inneholder underenhetene β, β′, α og 2ω mens holoenzymet inneholder sigmafaktoren. Dessuten er en hjelpefaktor til RNA-polymerase kjent som rho-faktoren også svært viktig for bakteriell transkripsjon.
Hva er Sigma Factor?
Sigma-faktor eller spesifisitetsfaktor er et protein som trengs for initiering av transkripsjon i bakterier. Det er en bakteriell transkripsjonsinitieringsfaktor. Denne faktoren muliggjør binding av RNA-polymeraseenzym til en spesifikk region av DNA k alt promoterregionen under transkripsjon. Sigma-faktor er norm alt homolog med arkeal transkripsjonsfaktor B og eukaryotisk transkripsjonsfaktor TF11B. Dessuten varierer den spesifikke sigma-faktoren til et gitt gen avhengig av genet og miljøsignaler. Promotorene velges av RNA-polymerase avhengig av sigmafaktoren assosiert med den.
Figur 01: Sigma Factor
Sigmafaktoren kan også finnes i kloroplasten til planter som en del av plastid-kodet polymerase (PEP). Sigma-faktoren og RNA-polymerase er kjent som RNA-polymerase-holoenzym. Molekylvekten til sigmafaktoren er rundt 70 kDa. Etter initiering av transkripsjon, dissosierer sigmafaktoren fra komplekset. Deretter fortsetter RNA-polymerasen forlengelsen til transkripsjonen avsluttes.
Hva er Rho-faktor?
Rho-faktor er et prokaryot protein involvert i terminering av transkripsjon. Rho-faktor binder seg vanligvis til transkripsjonsterminatorpausestedet. Dette stedet er en eksponert region av enkelttrådet RNA nær den åpne leserammen ved cytosinrike guaninfattige sekvenser. Det er et essensielt transkripsjonsprotein i prokaryoter. I Escherichia coli er rho-faktoren omtrent 274,6 kDa heksamer av identiske underenheter. Hver underenhet har et RNA-bindende domene og ATP-hydrolysedomene. Dessuten er funksjonen til rho-faktoren helikaseaktivitet.
Figur 02: Rho-faktor
Rho-faktor binder seg til RNA-molekylet og bruker deretter ATPase-aktiviteten til å gi energi til å translokere RNA-molekyler. Rho-faktor utfører translokasjon til den når RNA-DNA-helix-regionen, hvor den vikler av hybrid (RNA-DNA) dupleksstrukturen. Denne prosessen stopper RNA-polymerase på termineringsstedet og avslutter transkripsjonsprosessen.
Hva er likhetene mellom Sigma-faktor og Rho-faktor?
- Sigma-faktor og rho-faktor er to viktige faktorer for bakteriell transkripsjon.
- Begge finnes kun i prokaryoter.
- De er proteiner som består av aminosyrer.
- Begge er nukleinsyrebindende proteiner.
- Prokaryoter er sterkt avhengige av disse faktorene for å generere mRNA som kan lage særegne proteiner og hjelpe dem å reagere spesifikt på miljøet.
Hva er forskjellen mellom Sigma-faktor og Rho-faktor?
Sigma-faktor er et protein som trengs for initiering av transkripsjon i bakterier, mens rho-faktor er et protein som trengs for terminering av transkripsjon i bakterier. Så dette er nøkkelforskjellen mellom sigma-faktor og rho-faktor. Videre er sigma-faktoren et DNA-bindende protein, mens rho-faktoren er et RNA-bindende protein.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom sigma-faktor og rho-faktor i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – Sigma Factor vs Rho Factor
Transkripsjon er prosessen der informasjonen i DNA kopieres til et nytt molekyl k alt mRNA (messenger RNA). Dette m-RNA er til slutt involvert i å produsere et spesifikt protein. Sigma-faktor og rho-faktor er to viktige faktorer for bakteriell transkripsjon. De er proteiner. Sigma-faktor deltar i initieringen av transkripsjon i bakterier. Rho-faktor er ansvarlig for terminering av transkripsjon i bakterier. Dermed er dette oppsummeringen av forskjellen mellom sigma-faktor og rho-faktor.
