Nøkkelforskjellen mellom Rho-avhengig og Rho-uavhengig terminering er at i Rho-avhengig terminering, binder Rho-faktoren seg til transkripsjonen og avslutter transkripsjonen ved å bryte hydrogenbindinger mellom malen og transkripsjonen, mens Rho-uavhengig terminering avslutter transkripsjonen med produserer en hårnålsløkkestruktur og deretter U-rik region i transkripsjonen.
Transkripsjon er ett av de to stadiene av genuttrykk. Det er prosessen som produserer en mRNA-sekvens fra den genetiske informasjonen som er skjult i DNA-sekvensen til genet. Transkripsjon skjer via tre trinn: initiering, forlengelse og terminering. RNA-polymerase-enzym binder seg til promotorsekvensen til genet og begynner å katalysere syntesen av RNA-strengen. Inntil terminatorsekvensen er funnet, legger RNA-polymerase til nukleotider og bygger RNA-strengen. Hos prokaryoter skjer terminering gjennom to hovedtermineringsstrategier: Rho-avhengig terminering og Rho-uavhengig terminering. Rho-faktor er et protein som har helikaseaktivitet.
Hva er Rho-avhengig oppsigelse?
Rho-avhengig terminering er en av de to typene transkripsjonstermineringsstrategier som forekommer i prokaryoter. Rho-faktor er et protein som har helikaseaktivitet.
Figur 01: Rho-avhengig avslutning
Rho-protein binder seg til RNA-transkriptet og beveger seg langs RNA-polymerasen i 5'-3'-retningen, og oppmuntrer til dissosiasjon av hydrogenbindinger mellom DNA-malen og RNA-transkriptet. Når Rho-faktoren når transkripsjonsboblen, trekker den DNA/RNA-hybrid fra hverandre og frigjør transkripsjonen fra transkripsjonsboblen. Når dette skjer, avsluttes transkripsjonen.
Hva er Rho uavhengig oppsigelse?
Rho uavhengig terminering er den andre strategien som avslutter prokaryot transkripsjon. Vanligvis har en terminatorregion en invertert repetisjonssekvens. Umiddelbart etter den inverterte repetisjonssekvensen er det en adeninrik region (AAAA). Når RNA-polymerase beveger seg fremover, produserer den en mRNA-sekvens. Siden de to regionene er komplementære i den inverterte gjentatte sekvensregionen, danner den en hårnålsløkkestruktur på grunn av hydrogenbinding. Neste region blir den U-rike regionen. Hårnålsstrukturen stopper RNA-polymeraseaktiviteten.
Figur 02: Rho uavhengig oppsigelse
I de U-rike regionene er det dessuten svake interaksjoner mellom U-baser for transkripsjon og A-baser i malen. Disse svake Adenin-Uracil-bindingene destabiliserer DNA-malen og RNA-transkriptet og skiller hverandre. Til slutt frigjør transkripsjonen fra transkripsjonssiden.
Hva er likhetene mellom Rho Dependent og Rho Independent oppsigelse?
- Rho-avhengig og Rho-uavhengig terminering er to viktige termineringsstrategier som finnes i prokaryoter.
- Begge skjemaer frigir transkripsjon fra DNA-malen for å avslutte transkripsjonen.
Hva er forskjellen mellom Rho Dependent og Rho Independent Termination?
Rho-avhengig terminering medieres av et Rho-protein mens Rho-uavhengig terminering skjer via dannelsen av en hårnålsløkkestruktur. Så dette er nøkkelforskjellen mellom Rho-avhengig og Rho-uavhengig avslutning. Videre bruker Rho-protein ATP-energi mens Rho uavhengig avslutning ikke involverer Rho-protein og ikke bruker ATP-energi. Derfor er dette også en betydelig forskjell mellom Rho-avhengig og Rho-uavhengig avslutning.
Infografien nedenfor viser flere sammenligninger relatert til forskjellen mellom Rho-avhengig og Rho-uavhengig avslutning.
Sammendrag – Rho Dependent vs Rho Independent Termination
Rho-avhengig og Rho-uavhengig terminering er de to viktigste transkripsjonstermineringsmekanismene som forekommer i prokaryoter. Et Rho-protein er ansvarlig for transkripsjonsavslutningen i Rho-avhengig terminering. Derimot skjer Rho uavhengig avslutning via en dannelse av hårnålsløkkestrukturen. Så dette er hovedforskjellen mellom Rho-avhengig og Rho-uavhengig avslutning.
