Nøkkelforskjellen mellom gen-knockout og knockdown er at gen-knockout er en teknikk der genet av interesse fjernes fullstendig (inoperativ tilstand) for å studere funksjoner til genet, mens gen-knockdown er en annen teknikk der genet av interessen stanses for å undersøke rollen til det spesielle genet i et biologisk system.
Ulike genetiske teknikker er i drift for å undersøke funksjonen til gener i de levende biologiske systemene. Gen-knockout og knockdown er to slike teknikker. Disse teknikkene hjelper forskere med å identifisere funksjonelle aspekter ved ulike gener i levende organismer.
Hva er Gene Knockout?
Gen knockout er en genetisk teknikk som gjør at ett eller flere gener ikke fungerer i levende organismer. Dette er også en prosess for å slå av eller slette et gen fra en organisme. Den primære anvendelsen av denne teknikken er å studere genfunksjonen. Prosessen evaluerer effekten av det tapte eller fjernede genet. Knockout-prosessen involverer også visse enzymer og skjøteteknikker.
Figur 01: Gene Knockout
Det er få variasjoner i gen-knockout-teknikken basert på antall gener involvert. De er dobbel knockout (knockout av to gener), trippel knockout (knockout av tre gener) og firedobbel knockout (knockout av fire gener). Gen-knockout er videre klassifisert i to grupper; heterozygote knockouts og homozygote knockouts.
Hva er Gene Knockdown?
Gen knockdown er en eksperimentell prosedyre der denne prosedyren undertrykker eller reduserer ekspresjonen av et bestemt gen eller gener fra en organisme. Gendemping er den vanlige definisjonen på genknockdown. Under denne prosedyren involverer aktiveringen eller degraderingen av det produserte mRNA RNA-interferens (RNAi), lite interfererende RNA (siRNA) og kort hårnåls-RNA (shRNA).
Figur 02: Gendemping
Den primære bruken av genknockdown er å undersøke rollen til det spesielle genet i det biologiske systemet. Derfor gjennomfører denne teknikken studiet av onkogener (Bcl-2 og P53) og gener som forårsaker nevrologiske sykdommer, virusinfeksjoner og arvelige sykdommer.
Hva er likhetene mellom Gene Knockout og Knockdown?
- Både gen-knockout og gen-knockdown er genetiske teknikker.
- Disse to teknikkene kan forhindre genuttrykk.
- Den primære bruken av begge teknikkene er å undersøke funksjonen til genet av interesse.
- Begge er i stand til å identifisere forskjellige sykdomstilstander (genetiske).
- De kan begge brukes for ett eller flere gener av interesse.
Hva er forskjellen mellom Gene Knockout og Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gen knockout er in-operasjon av gener (fjerning av gener fra DNA) fra en organisme gjennom forskjellige genetiske teknikker. | Gen knockdown er en eksperimentell prosedyre for å undertrykke (redusere eller dempe) ekspresjonen av et bestemt gen eller gener fra en organisme. |
| Function | |
| Fasiliterer studiet av funksjoner til gener ved å analysere resultatene av det tapte genet. | Fasiliterer studiet av onkogener, gener som forårsaker nevrologiske sykdommer, virusinfeksjoner og arvelige sykdommer. |
| Involvering av RNA-agenter | |
| Involvering av RNA-agenter er ubetydelig i denne teknikken. | Prosessen involverer midler som siRNA, shRNA og RNAi for å inaktivere mRNA. |
| Bruk av kjemiske midler | |
| Enzymatiske midler brukes. | Ingen slike kjemiske midler brukes. |
| Effekt på gen | |
| Fjerner genet fullstendig fra DNA. | Undertrykk eller dempe genet. |
| Klassifisering | |
| Dobbel knockout, trippel knockout og firedobbel knockout og heterozygot og homozygot knockout er forskjellige typer gen-knockout. | Ingen slike klassifiseringssystemer er tilgjengelige for gendemping. |
Summary – Gene Knockout vs Gene Knockdown
De to teknikkene vi diskuterte her; genet knockout og knockdown, er metoder for å undersøke funksjonene til ulike gener. Gen-knockout gjør genet uvirksomt, mens gen-knockdown gjør genet av interesse. Imidlertid forhindrer begge prosedyrene genuttrykket. Ulike midler er i stand til å utføre disse to prosessene. Gen knock out er en type sletting mens gen knockdown er en type inaktivering. Dette er forskjellen mellom gen-knock-out og knockdown.
