Nøkkelforskjellen mellom rate sonal og isopycnic sentrifugering er at rate sonal sentrifugering er viktig for å separere partikler som er forskjellige i størrelse, men ikke i deres tetthet, mens isopycnic sentrifugering er viktig for å separere partikler som er forskjellige i tetthet, men ikke i deres størrelse.
Sentrifugering er en analytisk teknikk vi kan bruke for å separere partikler i en løsning basert på størrelse, form, tetthet, viskositet osv. på mediet. Her må vi plassere løsningen som inneholder de suspenderte partiklene i et sentrifugalrør og deretter sette røret inn i rotoren for å rotere det med en definert hastighet slik at partiklene vil skille seg fra løsningen.
Hva er rate sonesentrifugering?
Rate sonal sentrifugering er en analytisk teknikk vi kan bruke for å separere partikler av en løsning avhengig av størrelsen, men ikke av tettheten. Denne teknikken skiller med andre ord partiklene fra en løsning basert på størrelsen, men den tar ikke hensyn til forskjellene i partiklenes tetthet. Derfor er denne teknikken veldig nyttig for å skille cellulære organeller som endosomer. Dessuten kan vi bruke den til å skille proteiner også.
Figur 01: En bordsentrifuge
I tillegg er denne sentrifugeringen tidsavhengig. Dette betyr at posisjonen til prøven er relatert til tidspunktet for sedimentering. Gradienten vi får fra denne metoden er flat, og den maksimale tettheten til denne gradienten overskrider aldri tettheten til den maksim alt tette partikkelen i pelleten.
Hva er isopyknisk sentrifugering?
Isopycnic sentrifugering er en analytisk teknikk vi kan bruke for å separere partikler av en løsning avhengig av tettheten, men ikke av størrelsen. Det betyr; vi kan skille partikler i en løsning hvis de er forskjellige fra hverandre i sin tetthet. Hvis de er forskjellige i størrelse i stedet for tetthet, er ikke denne teknikken egnet for den separasjonen. Størrelsen på partikler påvirker bare migrasjonshastigheten til partiklene. Derfor er denne teknikken uavhengig av tid.
Figur 02: Tetthetsgradient gitt av sentrifugering
Enda viktigere, vi kan bruke denne teknikken til å skille nukleinsyrer i en gradient. Gradienten gitt ved isopyknisk sentrifugering er bratt. Dessuten produserer den ikke en pellet fordi separasjonen er basert på flyttetthetene til partikler.
Hva er forskjellen mellom rate sonal og isopyknisk sentrifugering?
Nøkkelforskjellen mellom hastighetssone- og isopyknisk sentrifugering er at hastighetssonesentrifugering er viktig for å separere partikler som er forskjellige i størrelse, men ikke i tetthet, mens isopyknisk sentrifugering er viktig for å separere partikler som er forskjellige i tetthet, men ikke i deres størrelse.
I tillegg er en annen signifikant forskjell mellom rate sonal og isopycnic sentrifugering at rate sone sentrifugering er tidsavhengig, mens isopycnic sentrifugering er uavhengig av tid. Dessuten er gradienten gitt av hastigheten sonesentrifugering flat, mens den ved isopyknisk sentrifugering er bratt.
Sammendrag – Vurder sone vs isopyknisk sentrifugering
Sentrifugering er en viktig analyseteknikk. Det er to former for sentrifugering som vi bruker i biologiske applikasjoner: rate sonal og isopycnic sentrifugering. Den viktigste forskjellen mellom hastighetssone- og isopyknisk sentrifugering er at hastighetssonesentrifugering er viktig for å separere partikler som er forskjellige i størrelse, men ikke i tetthet, mens den isopykniske sentrifugering er viktig for å separere partikler som er forskjellige i tetthet, men ikke i størrelse.
