Nøkkelforskjellen mellom Watson og Crick og Hoogsteen baseparing er at Watson og Cricks baseparing er standardmåten som beskriver dannelsen av basepar mellom puriner og pyrimidiner. I mellomtiden er Hoogsteen baseparing en alternativ måte å danne basepar der purinen har en annen konformasjon med hensyn til pyrimidin.
Et nukleotid har tre komponenter: en nitrogenholdig base, et pentosesukker og en fosfatgruppe. Det er fem forskjellige nitrogenholdige baser og to pentosesukkere involvert i strukturen til DNA og RNA. Når disse nukleotidene danner en nukleotidsekvens, danner komplementære baser, enten puriner eller pyrimidiner, hydrogenbindinger mellom dem. Dette er kjent som baseparing. Derfor dannes et basepar ved å forbinde to nitrogenholdige baser med hydrogenbindinger. Watson og Cricks baseparing er den klassiske eller standard tilnærmingen, mens Hoogsteen baseparing er en alternativ måte å danne basepar på.
Hva er Watson og Crick-baseparing?
Watson og Cricks baseparing er standardmetoden som forklarer baseparingen av nitrogenholdige baser i nukleotider. James Watson og Francis Crick, i 1953, forklarte denne baseparingsmetoden, som stabiliserer dobbeltstandardspiralene til DNA. I følge Watson og Crick baseparing danner adenin hydrogenbindinger med tymin i DNA og med uracil i RNA. Dessuten danner guanin hydrogenbindinger med cytosin i både DNA og RNA.
Figur 01: Watson og Crick-baseparing
Det er tre hydrogenbindinger mellom G og C, mens det er to hydrogenbindinger mellom A og T. Disse baseparene lar DNA-helixen opprettholde sin vanlige spiralstruktur. De fleste nukleotidsekvenser (60 %) har Watson- og Crick-basepar som er stabile ved nøytral pH.
Hva er Hoogsteen Base Pairing?
Hoogsteen-baseparing er en alternativ måte å danne basepar i nukleinsyrer. Dette ble først beskrevet av den amerikanske biokjemikeren Karst Hoogsteen i 1963. Hoogsteen basepar ligner på Watson og Crick basepar. De forekommer mellom adenin (A) og tymin (T), og guanin (G) og cytosin (C). Men purin har en annen konformasjon med hensyn til pyrimidin. I A- og T-basepar roteres adeninet i 1800 rundt glykosidbindingen, noe som tillater et alternativt hydrogenbindingsskjema. Tilsvarende, i G- og C-par, roteres guanin 180° rundt glykosidbindingen. Dessuten er vinkelen på glykosidbindinger større i Hoogsteen basepar. Dessuten er dannelsen av Hoogsteen basepar ikke stabil ved nøytral pH.
Figur 02: Watson og Crick baseparing vs Hoogsteen baseparing
Hoogsteen basepar er ikke-kanoniske basepar som gjør nukleotidsekvensene mindre stabile enn standard baseparing. Dessuten kan de resultere i forstyrrelse av DNA-dobbelthelix. Selv om Hoogsteen basepar forekommer naturlig, er de svært sjeldne.
Hva er likhetene mellom Watson og Crick og Hoogsteen baseparing?
- Watson og Crick og Hoogsteen baseparing er to måter å beskrive dannelsen av basepar i nukleinsyrer.
- Begge forekommer naturlig i DNA.
- Dessuten eksisterer de i likevekt med hverandre.
- Basepar er like i begge metodene.
Hva er forskjellen mellom Watson og Crick og Hoogsteen baseparing?
Watson og Crick baseparing er standardmåten som beskriver dannelsen av basepar mellom puriner og pyrimidiner. På den annen side er Hoogsteen baseparing en alternativ måte å danne basepar der purinen har en annen konformasjon med hensyn til pyrimidin. Så dette er nøkkelforskjellen mellom Watson og Crick og Hoogsteen baseparing. Watson og Crick baseparing ble beskrevet av James Watson og Francis Crick i 1953, mens Hoogsteen baseparing ble beskrevet av Karst Hoogsteen i 1963. Dessuten er Watson og Crick basepar stabile mens Hoogsteen basepar vanligvis er mindre stabile.
Infografikken nedenfor oppsummerer forskjellen mellom Watson og Crick og Hoogsteen baseparing.
Sammendrag – Watson og Crick vs Hoogsteen baseparing
Watson og Crick-baseparing og Hoogsteen-baseparing er to typer måter som beskriver dannelsen av nitrogenholdige baser i nukleotidsekvenser. I Hoogsteen baseparing har purinbasen en annen konformasjon med hensyn til pyrimidinbase. Så dette er nøkkelforskjellen mellom Watson og Crick og Hoogsteen baseparing. Dessuten stabiliserer Watson- og Crick-basepar DNA-dobbelthelixen mens Hoogsteen-basepar gjør helixen ustabil. Begge typer basepar forekommer imidlertid naturlig, og de eksisterer i likevekt med hverandre.
