Nøkkelforskjellen mellom CDS og cDNA er at CDS eller kodende sekvens er den delen av et transkripsjon som faktisk blir oversatt til protein mens cDNA-sekvensen er en DNA-sekvens avledet fra mRNA ved revers transkripsjon.
Et gen er en nukleotidsekvens som koder for et protein. Den består av forskjellige regioner som promotorregion, transkripsjonsinitieringssted, eksoner, startkodon, introner og stoppkodon. Derfor har et gen både kodende og ikke-kodende sekvenser. Kodesekvenser eller CDS refererer til eksonene og to kodoner, som er startkodon og stoppkodon. Det er sekvensen som faktisk blir oversatt til et protein. Derimot er cDNA en DNA-sekvens avledet fra mRNA ved revers transkripsjon.
Hva er CDS?
CDS eller kodende sekvens er en del av et gen som faktisk er oversatt til et protein. Den består av eksoner og to kodoner som AUG-kodon og stoppkodon. I motsetning til cDNA, inneholder ikke CDS to uoversatte regioner: 5' UTR og 3' UTR. Dessuten er introner ikke inkludert i CDS.
Figur 01: Kodesekvens
Sammenlignet med hele genomet og et individ, er kodende sekvenser en liten brøkdel. Kodesekvensen består av den nødvendige nukleotidsekvensen for å lage aminosyresekvensen til proteinet.
Hva er cDNA?
cDNA eller komplementært DNA er en DNA-sekvens generert fra mRNA-sekvens. Det syntetiseres av prosessen som kalles omvendt transkripsjon. Enzymet revers transkriptase katalyserer cDNA-syntese, og mRNA-sekvensen fungerer som mal for cDNA-syntese. I utgangspunktet kan mRNA fra eukaryote celler ekstraheres og renses for å lage cDNA. Etter å ha konstruert cDNA fra mRNA, kan de deretter klones inn i en bakteriecelle for å lage cDNA-biblioteker. cDNA-biblioteker er viktige for analyse av kodende regioner, genfunksjoner og ekspresjon av gener osv.
Figur 02: cDNA
I motsetning til kodende sekvens, inneholder cDNA to UTR-er, som er 3' UTR og 5' UTR. I likhet med kodingssekvensen inneholder ikke cDNA introner.
Hva er likhetene mellom CDS og cDNA?
- CDS og cDNA er nukleinsyrer.
- De er laget av deoksyribonukleotider.
- Både CDS og CDNA inneholder ikke introner, som er ikke-kodende regioner.
- Begge inneholder den genetiske koden eller informasjonen for å produsere et protein.
Hva er forskjellen mellom CDS og cDNA?
CDS eller kodende sekvens er den delen av et gen som faktisk er oversatt til et protein. På den annen side er cDNA-sekvens en DNA-sekvens avledet fra mRNA ved revers transkripsjon. Så dette er nøkkelforskjellen mellom CDS og cDNA. Dessuten består CDS av eksoner og to kodoner, som er startkodon og stoppkodon. Derimot består cDNA av den komplette mRNA-sekvensen og to UTR-er.
I tillegg gjøres cDNA-syntese kunstig fra mRNA ved revers transkripsjon mens CDS finnes i det genomiske DNA.
Infografikken nedenfor viser flere sammenligninger for å se forskjellen mellom CDS og cDNA.
Sammendrag – CDS vs cDNA
Kodesekvens og cDNA er to typer nukleotidsekvenser. Kodesekvensen ligger i et gen mens cDNA syntetiseres kunstig. Kodende sekvens har eksoner og to kodoner mens cDNA har en mRNA-sekvens og to UTR-er. Både CDS og cDNA har bare nukleotidsekvensene som faktisk oversettes til et protein. De inneholder ikke introner. I motsetning til CDS, krever cDNA-synteseprosessen omvendt transkriptase-enzym. Dessuten kan cDNA konvertere til cDNA-biblioteker. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom CDS og cDNA.
