Nøkkelforskjellen mellom TATA- og CAAT-boksen er at TATA-boksen er en konservert nukleotidregion som har en konsensussekvens av TATAWAW, mens CAAT-boksen er en konservert nukleotidregion med en konsensussekvens av GGCCAATCT.
TATA-boks og CAAT-boks er to regioner av nukleotider som påvirker transkripsjon av eukaryote gener. De er ikke-kodende DNA-sekvenser funnet oppstrøms til transkripsjonsinitieringsstedet. Faktisk finnes de i den regulatoriske regionen, som er kjent som promoteren. Både TATA-boks og CAAT-boks er ansvarlig for effektiviteten av transkripsjon. De er konsensussekvenser som ikke har endret seg gjennom hele evolusjonsprosessen.
Hva er TATA Box?
TATA-boks eller Goldberg-Hogness-boks er en konsensussekvens som finnes i promotorregionen til eukaryote gener. TATA-boksen er et kjerneelement i promoteren. Den ligger 25 basepar oppstrøms for transkripsjonsinitieringsstedet. Det er bevart gjennom hele evolusjonsprosessen. Konsensussekvensen til TATA-boksen er TATAWAW, der W er enten A eller T. Det er en ikke-kodende DNA-sekvens. Imidlertid er TATA-boks viktig for transkripsjonen av genet. Det er bindingsstedet til TATA-bindende protein (TBP) og andre transkripsjonsfaktorer. Når de binder seg inn i TATA-boksen, skjer rekruttering av RNA-polymerase II og riktig regulering av transkripsjon i eukaryote gener.
Figur 01: TATA-boks
Siden TATA-boksen er involvert i reguleringen av transkripsjon, kan mutasjoner av TATA-boksen resultere i fenotypiske endringer som fører til sykdommer som magekreft, spinocerebellar ataksi, Huntingtons sykdom, blindhet, β-thalassemi, immunsuppresjon, Gilberts syndrom, og HIV-1, etc.
Hva er CAAT Box?
CAAT-boksen er en region av nukleotider med konsensussekvensen til GGCCAATCT. I likhet med TATA-boksen er CAAT-boksen også lokalisert i promotorregionen til genet. Derfor er den lokalisert omtrent 75-80 basepar oppstrøms for transkripsjonsstedet.
Figur 02: CAAT-boks
Spesifikke transkripsjonsfaktorer binder seg til CAAT-boksen. Denne bindingen stabiliserer preinitieringskomplekset for lettere binding av enzymet RNA-polymerase. På samme måte fungerer CAAT-boksen som en regulatorisk sekvens. Mutasjoner i CAAT-boksregionen påvirker i stor grad promoterresponsen og reguleringen av transkripsjon.
Hva er likhetene mellom TATA og CAAT Box?
- TATA og CAAT er to regioner av nukleotider som finnes i den regulatoriske sekvensen til eukaryote gener.
- De finnes oppstrøms til transkripsjonsinitieringsstedet.
- Begge er konsensus-DNA-sekvenser.
- De er avgjørende for regulering av transkripsjon, så de er regulatoriske sekvenser.
Hva er forskjellen mellom TATA og CAAT Box?
TATA-boks er en konservert nukleotidregion funnet omtrent 25-30 basepar oppstrøms for transkripsjonsinitieringsstedet. På den annen side er CAAT-boks en bevart region av nukleotider funnet rundt 75-80 basepar oppstrøms til transkripsjonsinitieringsstedet. Så dette er nøkkelforskjellen mellom TATA og CAAT-boksen. Dessuten har TATA-boksen en konsensussekvens av TATAWAW mens GGCCAATCT er konsensussekvensen til CAAT-boksen.
En annen signifikant forskjell mellom TATA- og CAAT-boksen er dessuten at TATA-boksen gir et bindingssted for TBP og transkripsjonsfaktorer og deltar i transkripsjonsregulering mens CAAT-boksen signaliserer bindingssetet for RNA-transkripsjonsfaktoren.
Infografikken nedenfor oppsummerer forskjellene mellom TATA- og CAAT-boksen.
Sammendrag – TATA vs CAAT Box
TATA-boksen og CAAT-boksen er to deler av den konserverte regionen til eukaryote genpromotere. De er lokalisert oppstrøms for transkripsjonsinitieringsstedet. Begge påvirker transkripsjonen av gener ved å gi steder for binding av TATA-bindende proteiner og transkripsjonsinitieringsfaktorer. TATA-boksen er plassert 25-35 basepar oppstrøms for transkripsjonsinitieringsstedet, mens CAAT-boksen er lokalisert 75-80 basepar oppstrøms for transkripsjonsinitieringsstedet. Konsensussekvensen til TATA-boksen er TATAWAW mens konsensussekvensen til CAAT-boksen er GGCCAATCT. Dermed er dette sammendraget av forskjellen mellom TATA- og CAAT-boksen.
