Nøkkelforskjellen mellom sammensatte transposoner og IS-elementer er at sammensatte transposoner er en type transposoner som bærer tilleggsgener som antibiotikaresistensgener, mens IS-elementer (eller Insertion Sequence-elementer) er transponerbare elementer som bare bærer gener som kodetransposase som katalyserer transponeringsaktiviteten.
Et transposon er et fragment av DNA som kan endre sin posisjon i bakteriegenomet. Derfor er de mobile DNA-sekvenser. De flytter inn på nye steder i genomet, gjør endringer i sekvensen til bakteriegenomet, og forårsaker betydelige endringer i genetisk informasjon. Transposoner er også kjent som hoppende gener siden de kan blokkere transkripsjonen av gener og omorganisere bakteriens genetiske materiale. Dessuten er de ansvarlige for bevegelsen av medikamentresistens, antibiotikaresistensgener mellom plasmider og kromosomer. Sammensatte transposoner og IS-elementer er to typer mobile genetiske elementer som finnes i bakterier. Begge kan flytte fra ett sted til et annet i genomet.
Hva er sammensatte transposoner?
Et sammensatt transposon er et segment av DNA flankert av to kopier av lignende innsettingssekvenselementer. Det er en sentral proteinkodende region i sammensatt transposon. Genene er ofte antibiotikaresistente gener. De kan også inneholde katabolske gener. Dessuten består sammensatt transposon av to inverterte repetisjoner. Hele lengden av den sammensatte transposonen beveger seg som én komplett enhet.
Figur 01: Composite Transposon
Tn10 er en sammensatt transposon. Den består av en 6,5 kb sentral kodende region (tetracyklin-resistent gen) og 1,4 kb inverterte insersjonssekvenselementer i hver ende. IS-elementer leverer transposase. Transposase er et enzym som katalyserer bevegelsen av transposonet. Sammensatte transposoner kan forsterkes ved å designe primere for IS-elementer.
Hva er IS-elementer?
Innsettingssekvenselementer eller IS-elementer er en type mobil genetisk element. De er en enkel form for transposoner. De bærer bare genene som koder for transposase-enzymer. Transposase-enzymer katalyserer transposisjonen av transposoner. Strukturelt er kodingssekvensen til IS-elementer flankert av to inverterte repetisjoner. For eksempel er IS-element k alt IS911 flankert av to 36bp inverterte gjentatte ekstremiteter.
IS-elementer er de mest tallrike autonome transponerbare elementene i bakteriegenomet. Derfor er de ekstremt viktige for prokaryot genomorganisering og evolusjon. Videre forekommer IS-elementer som deler av sammensatte transposoner. Vanligvis finnes to IS-elementer som flankerer kodingssekvensen til den sammensatte transposonen. Men enhetstransposoner har ikke flankerende IS-elementer.
Siden IS-elementer kan bevege seg innenfor genomet, kan de avbryte kodingssekvensen til andre gener og inaktivere genene ved å blokkere ekspresjon.
Hva er likhetene mellom sammensatte transposoner og IS-elementer?
- Både sammensatte transposoner og IS-elementer er i stand til å endre posisjonen i bakteriegenomet.
- Kodeområdet i begge transposonene er vanligvis flankert av inverterte repetisjoner.
- En sammensatt transposon er flankert av to separate IS-elementer.
Hva er forskjellen mellom sammensatte transposoner og IS-elementer?
Kompositttransposoner er mobile genetiske elementer som består av to insersjonssekvenser (IS) som ofte flankerer ett eller flere antibiotikaresistensgener. På den annen side er IS-elementer en type enkelt transponerbart element som inneholder gener som koder for transposase-enzym for å katalysere transposisjon. Så dette er hovedforskjellen mellom sammensatte transposoner og IS-elementer.
Nedenfor er en liste over forskjeller mellom sammensatte transposoner og IS-elementer i tabellform for side ved side-sammenligning.
Summary – Composite Transposons vs IS Elements
Et bakteriegenom har genetiske elementer som er mobile. Sammensatte transposoner og IS-elementer er to typer mobile genetiske elementer. Sammensatte transposoner bærer antibiotika-resistente gener og flankerende IS-elementer. IS-elementer bærer den genetiske koden for å produsere transposase som katalyserer bevegelsen av transposoner. Dermed er dette hovedforskjellen mellom sammensatte transposoner og IS-elementer.
