nøkkelforskjellen mellom RNA-interferens og antisense-oligonukleotid er at RNA-interferens er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et dobbelttrådet RNA mens antisense-oligonukleotid er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et enkelttrådet DNA-oligonukleotid.
Gendemping eller undertrykkelse er en måte å regulere genuttrykk i en biologisk celle for å forhindre ekspresjon av et spesifikt gen. Norm alt, når gener blir stilnet, reduseres uttrykket deres. I kontrast, når gener blir slått ut, blir de fullstendig slettet fra organismens genom; vil derfor ikke ha noe uttrykk. Noen ganger betraktes gendemping som det samme som genet knockdown. Dette er fordi gendempingsmetoder som RNAi, antisense-oligonukleotid og CRISPR som brukes til å dempe gener forårsaker en reduksjon av genuttrykk med minst 70 %. RNA-interferenser og antisense-oligonukleotider er to viktige gendempingsteknikker.
Hva er RNA-interferens?
RNA-interferens (RNAi) er en biologisk prosess der dobbelttrådede RNA-molekyler utfører sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk. Andrew Fire og Craig C. Mello delte Nobelprisen i 2006 i medisin for deres eksepsjonelle arbeid med RNA-interferens i nematodeorm: Caenorhabditis elegans. Denne banebrytende forskningen på RNA-interferens ble først publisert av dem i 1998. Vanligvis finnes RNAi-banen i mange eukaryote organismer, inkludert dyr.
Figur 01: RNA-interferens
To sentrale molekyler, mikroRNA (miRNA) og lite interferens-RNA (siRNA), er involvert i RNAi-banen. Et enzym k alt Dicer induserer denne veien. Dicer sp alter langt dobbelttrådet RNA til korte dobbelttrådete fragmenter (21 nukleotider siRNA). Deretter vikles hver siRNA av til to enkelttrådet RNA kjent som passasjerstreng og guidestreng. Passasjerstrengen degraderes mens guidestrengen er inkorporert i det RNA-induserte lyddempingskomplekset (RISC). I RISC pares guidestreng med komplementær mRNA, som utløser Argonaute (Ago2), den katalytiske komponenten i RISC-komplekset. Senere sp alter Argonaute mRNA-molekylet. I motsetning til siRNA, retter mikroRNA (miRNA) seg mot den 3' uoversatte regionen av mRNA hvor de binder seg med ufullkommen komplementaritet. Dette blokkerer tilgang av mRNA til ribosomer for translasjon.
Hva er antisense-oligonukleotid?
Antisense-oligonukleotid er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et enkelttrådet DNA-oligonukleotid. Denne teknikken kalles også antisense therapy Det er en form for terapi som bruker antisense-oligonukleotider (ASOs) for å målrette budbringer-RNA (mRNA). Antisense-oligonukleotider endrer mRNA-ekspresjonen ved å bruke en rekke mekanismer som ribonuklease H-mediert nedbrytning av pre-mRNA, direkte sterisk blokkering og modulering av eksoninnhold gjennom spleisingsstedbinding på pre-mRNA.
Figur 02: Antisense-oligonukleotid
Flere antisense-oligonukleotider er godkjent av USA og EU for sykdomsbehandling. Dessuten har antisense-oligonukleotider allerede blitt godkjent som terapi for mange sykdommer, inkludert Batten-sykdom, cytomegalovirusretinitt, Duchenne muskeldystrofi, familiært kylomikronemisyndrom, familiær hyperkolesterolemi, arvelig transtyretinmediert amyloidose, og spinal muskelatrofirofy.
Hva er likhetene mellom RNA-interferens og antisense-oligonukleotid?
- RNA-interferens og antisense-oligonukleotid er to viktige gendempingsteknikker.
- Begge teknikkene retter seg mot mRNA-molekyler.
- De er sekvensspesifikke teknikker.
- Begge teknikkene brukes som terapi for mange sykdommer.
- De hemmer begge genuttrykk.
Hva er forskjellen mellom RNA-interferens og antisense-oligonukleotid?
RNA-interferens er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et dobbelttrådet RNA mens antisense-oligonukleotid er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et enkelttrådet DNA-oligonukleotid. Så dette er nøkkelforskjellen mellom RNA-interferens og antisense-oligonukleotid.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom RNA-interferens og antisense-oligonukleotid i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – RNA-interferens vs antisense-oligonukleotid
Teknikker for gendemping reduserer cellulært genuttrykk. RNA-interferens og antisense-oligonukleotid er to viktige teknikker for gendemping. RNA-interferens er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et dobbelttrådet RNA, mens antisense-oligonukleotid er en teknikk som involverer sekvensspesifikk undertrykkelse av genuttrykk av et enkelttrådet DNA-oligonukleotid. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom RNA-interferens og antisense-oligonukleotid.
