Nøkkelforskjellen mellom replikativ transposisjon og klipp og lim transposisjon er at i replikativ transposisjon kopieres transposonet til et nytt sted, mens i klipp og lim transponering flyttes transposonet til et nytt sted.
Transponerbare elementer eller hoppende gener er DNA-sekvenser som kan endre sin posisjon i genomet. Dette omtales som transponering. Transposisjon kan noen ganger skape eller reversere mutasjoner, og endre cellens genetiske identitet og genomstørrelse. Transponering ble oppdaget av Barbara McClintock i 1983. Transponering kan skje gjennom to teknikker som duplisering og klipp og lim.
Hva er replikativ transposisjon?
Replikativ transposisjon er en type transponeringsmekanisme som hjelper transposoneksisjon fra det opprinnelige stedet til et annet gjennom replikert eller duplisert teknikk. Denne mekanismen ble først funnet av James A Shapiro i 1979. I denne mekanismen dupliseres det transponerbare elementet under transponeringsreaksjonen slik at transponeringsenheten er en kopi av det originale elementet. Dessuten, i denne mekanismen, danner donor- og reseptor-DNA-sekvensene en karakteristisk mellomliggende "theta"-konfigurasjon k alt Shapiro-mellomprodukt (kointegrert). Replikativ transposisjon er en karakteristisk retrotransposon. Denne mekanismen forekommer vanligvis i klasse I-transposoner.
Figur 01: Replikativ transposisjon
Et godt eksempel på replikativ transposisjon kan observeres i E. coli TN3-transposon. TN3-transposon kan bevege seg fra det opprinnelige plasmidet til et annet målplasmid gjennom replikert eller duplisert teknikk. Hele denne hendelsen formidles av to viktige enzymer k alt transposase og resolvase. Videre kan replikativ transposisjon observeres i både DNA-transposoner og retroposoner. Det best studerte transponerbare bakterieviruset er bakteriofagen Mu.
Hva er Cut and Paste-transponering?
Klipp og lim transposisjon er en type transponeringsmekanisme som hjelper til med transposoneksisjon fra det opprinnelige stedet til et annet gjennom klipp og lim-teknikken. Denne mekanismen er også kjent som den konservative modellen for transponering. I denne ikke-replikative transposisjonen skjer utskjæringen og integreringen av en transposon fra ett genomisk sted til et annet uten å etterlate en kopi.
Figur 02: Klipp ut og lim inn transposisjon
I denne mekanismen binder transposase-enzymet seg først til de terminale repetisjonene som vanligvis er tilstede på begge ender av transposonene, og det danner deretter en struktur som kalles synaptisk kompleks (transpososom). Det synaptiske komplekset sp alter transposonet fra dets opprinnelige genomiske plassering og integrerer det i det nye målstedet. Etter det går transposaser fra begge ender av transposonen. Når transposase-enzymet forlater transposonet, fylles hullene av vertspolymerase-enzymet. Dette tillater fullstendig sammenføyning av transposonet til den nye genomiske plasseringen. Denne mekanismen forekommer norm alt i klasse II-transposoner. Videre er TN5 bakterielle transposoner et velkjent eksempel som viser en konservativ eller klipp og lim transposisjonsmekanisme.
Hva er likhetene mellom replikativ transposisjon og klipp og lim transposisjon?
- Replikativ transponering og klipp og lim transponering er to typer transponeringsmekanismer.
- I begge mekanismene beveger de transponerbare elementene seg fra ett genomisk sted til et annet nytt genomisk sted.
- Begge mekanismene kan skape eller reversere mutasjoner og endre cellens genetiske identitet.
- Bakterielle transposoner viser begge mekanismene.
- De er ekstremt viktige hendelser for evolusjon.
Hva er forskjellen mellom replikativ transposisjon og klipp og lim transposisjon?
Replikativ transposisjon er en type transponeringsmekanisme der transposonen kopieres til et nytt sted, mens klipp og lim transposisjon er en type transponeringsmekanisme der transposonen flyttes til et nytt sted. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom replikativ transposisjon og klipp og lim transposisjon. Videre forekommer replikativ transponering norm alt i klasse I-transposoner, mens klipp og lim-transposisjon norm alt forekommer i klasse II-transposoner.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom replikativ transponering og klipp og lim transponering i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – Replikativ transposisjon vs klipp og lim transposisjon
Replikativ transposisjon og klipp og lim transponering er to typer transponeringsmekanismer. Replikativ transponering er en type transponeringsmekanisme der transposonet kopieres til et nytt sted, mens klipp og lim transposisjon er en type transponeringsmekanisme der transposonet flyttes til et nytt sted. Så dette oppsummerer forskjellen mellom replikativ transposisjon og klipp og lim transposisjon.
