Nøkkelforskjellen mellom guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid er at guanidintiocyanat er en sterkere proteindenatureringsmiddel som er mer vanlig brukt i RNA-isolering, mens guanidinhydroklorid er en svakere proteindenatureringsmiddel som er mindre vanlig i RNA-isolering.
Denaturering er prosessen der proteiner mister sin kvaternære struktur, tertiære struktur og sekundære struktur som norm alt er tilstede i deres opprinnelige tilstand. Det kan gjøres ved påføring av ytre stress eller forbindelser som en sterk syre eller base, et konsentrert uorganisk s alt, et organisk løsningsmiddel (alkohol, kloroform), agitasjon, stråling eller varme. Guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid er to forskjellige typer proteindenatureringsmidler.
Hva er guanidintiocyanat?
Guanidintiocyanat (GTC) er et sterkere proteindenaturerende middel som er mer vanlig brukt i RNA-isolering. Det er også kjent som guanidinium isothiocyanat (GITC). Siden det er et kaotropisk middel, er det en kjemisk forbindelse som rutinemessig brukes som en generell proteindenatureringsmiddel. Et kaotropt middel er et molekyl i en vannløsning som kan forstyrre hydrogenbindingsnettverket mellom vannmolekyler. Dette har en effekt på stabiliteten til den native tilstanden til andre molekyler i løsningen, slik som makromolekyler som proteiner og nukleinsyrer ved å svekke den hydrofobe effekten. Kaotropiske midler som guanidintiocyanat reduserer mengden orden i strukturen til protein dannet av vannmolekyler både i bulk og hydreringsskall rundt hydrofobe aminosyrer. Dette kan forårsake proteindenaturering.
Guanidintiocyanat kan brukes til å deaktivere virus som influensa som forårsaket sykdommer som spanskesyken i 1918. Derfor kan den brukes i medisinske eller sykehusoppsett. Videre brukes guanidintiocyanat også til å lysere celler og viruspartikler i RNA- og DNA-ekstraksjoner. Her er funksjonen til guanidintiocyanat å hjelpe til med lyserende virkning og å forhindre aktiviteten til RNase-enzymer og DNase-enzymer ved denaturering. Disse enzymene ville ellers skade ekstraktet (RNA eller DNA).
Hva er guanidinhydroklorid?
Guanidinhydroklorid (GdnHCl) er et svakere proteindenatureringsmiddel som er mindre vanlig i RNA-isolering. Det er også kjent som guanidiniumklorid (GdmCl). Det er hydroklorids altet av guanidin. Guanidinhydroklorid er kaotropisk og en av denaturantene som brukes i fysiokjemiske studier av proteinfolding.
Figur 01: Guanidinhydroklorid
Guanidinhydroklorid har også evnen til å redusere enzymaktivitet og øke løseligheten til hydrofobe molekyler. Norm alt, ved høyere konsentrasjoner av guanidinhydroklorid, mister proteiner sin ordnede struktur. Proteiner har en tendens til å bli tilfeldig kveilet ved denne konsentrasjonen av guanidinhydroklorid. I medisinske eller sykehusoppsett er guanidinhydroklorid indisert for å redusere symptomene på muskelsvakhet og lett tretthet assosiert med sykdommen Eaton-Lambert syndrom. Videre kan bivirkninger ved bruk av guanidinhydroklorid inkludere perist altikk, diaré og dødelig benmargsundertrykkelse.
Hva er likhetene mellom guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid?
- Guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid er to forskjellige typer proteindenatureringsmidler.
- Begge denaturantene har guanidin i strukturen.
- De er kaotrope agenter.
- Begge denaturantene kan brukes til RNA-isolering.
- De brukes begge i medisinske eller sykehusoppsett.
Hva er forskjellen mellom guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid?
Guanidintiocyanat er et sterkere proteindenatureringsmiddel som er mer vanlig brukt i RNA-isolering, mens guanidinhydroklorid er et svakere proteindenatureringsmiddel som er mindre vanlig å bruke i RNA-isolering. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid. Videre er den kjemiske formelen til guanidintiocyanat C2H6N4S, mens den kjemiske formelen av guanidinhydroklorid er CH5N3HCl.
Infografien nedenfor viser forskjellene mellom guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid i tabellform for sammenligning side ved side.
Sammendrag – Guanidin Tiocyanate vs Guanidine Hydrochloride
Guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid er to forskjellige typer proteindenatureringsmidler. Begge denaturantene er kaotrope. Guanidintiocyanat er et sterkere proteindenatureringsmiddel som er mer vanlig brukt i RNA-isolering, mens guanidinhydroklorid er et svakere proteindenatureringsmiddel som er mindre vanlig i RNA-isolering. Så dette oppsummerer forskjellen mellom guanidintiocyanat og guanidinhydroklorid.
