Transposon vs Retrotransposon
Transposoner og retrotransposoner er genetiske komponenter i DNA, og det er store forskjeller mellom dem. Den prosentvise tilstedeværelsen av disse genetiske materialene varierer på tvers av arter, og deres funksjoner bestemmer skjebnen til organismen med mutasjoner og andre fenotypisk viktige endringer. Transposoner og retrotransposoner er gener eller samlinger av visse gener lokalisert i DNA-trådene, og endringer i deres plassering har vært hovedårsakene til disse konsekvensene. Imidlertid har denne artikkelen til hensikt å diskutere funksjonene til disse genene kort og presenterer en sammenligning mellom transposoner og retrotransposoner.
Hva er Transposon?
Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter av DNA med evnen til å endre plasseringen av DNA-tråden i form av klippe- og limmekanisme. På grunn av denne mobile naturen til transposonene, er disse kjent som hoppende gener. Transposoner er av to hovedtyper kjent som klasse I-transposoner og klasse II-transposoner. Vanligvis blir Klasse II-typen referert til som transposonene og Klasse I-typen referert til som retrotransposonene. Prosessene med å kutte og lime av mobile DNA-segmenter reguleres av enzymet transposase. Enzymet binder seg til begge ender av transposonet og kutter fosfodiesterbindingene til DNA-strengen, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder seg på det nye stedet. Imidlertid er denne prosessen interessant å forstå, ettersom noen transposoner bare kan flytte til visse steder bare på grunn av inkompatibiliteten til basesekvenser med målstedet. Gener med den ene enden av en enkelt tråd har samme basesekvens med den andre enden av den andre enkeltstrengen er transposoner med klebrige kanter, fordi de kan binde seg til sidene til mål-DNA-tråden med samme basesekvens som i de klebrige endene. Imidlertid kan denne mobiliteten av gener forårsake endringer av genotypen så vel som i fenotypen til organismen. Forskere oppfunnet om transposonene og genmodifisert mat og organismer i henhold til de foretrukne tilpasningene ble deretter gjort tilgjengelig. Høyproduktive landbruksvekster, antibiotika med medisinske egenskaper, husdyr var noen av de fordelaktig utviklede produktene etter oppfinnelsen av transposoner av Barbara McClintock på 1940-tallet.
Hva er retrotransposon?
Retrotransposoner er klasse I-transposonene, og disse beveger seg gjennom genomet gjennom mekanismen for kopiering og lim. Mekanismen for mobiliteten til retrotransposoner involverer få store trinn som kopiering av gensegmentet til DNA-tråden til RNA, overføring av kopien av RNA til målstedet, transkripsjon av RNA-sekvensen tilbake til DNA ved bruk av revers transkriptase og innsetting av genet til den nye plasseringen av DNA-strengen av genomet. De to endene av disse retrotransposonene har vanligvis lange terminale repetisjoner med omtrent 1000 basepar, og de brukes som identifikasjonstrekk for disse genene. Disse genene forsterkes lett inne i genomet, og prosentandelen av retrotransposonene i det menneskelige genomet er omtrent 50 %. Disse kan være ganske farlige ettersom det forårsakende viruset til AIDS, HIV og T-celleleukemivirus har retrotransposonene i RNA-genomene. Faktisk kan disse virusene binde retrotransposonene til et hvilket som helst sted i de menneskelige DNA-trådene ved bruk av revers transkriptase og integrase. Integrase-enzymet fungerer på samme måte som transposase i klasse II-transposoner.
Hva er forskjellen mellom Transposon og Retrotransposon?
• Transposoner er klasse II hoppende gener mens retrotransposoner faller i kategorien klasse I.
• Transposoner fungerer med transposase-enzymet, mens retrotransposoner fungerer med bruk av to hovedenzymer kjent som revers transkriptase og integrase.
• Terminalendene er mye lengre i retrotransposoner enn i transposoner.
• Transposoner kuttes fra origo og limes inn ved målet; omvendt blir retrotransposoner kopiert fra origo til RNA og transkribert ved målet.
• Flytting av retrotransposoner involverer RNA, men ikke i transposoner.
