siRNA vs miRNA
RNA er svært viktige molekyler, som bidrar til å bygge opp organismenes liv. Nylig har forskere oppdaget små RNA k alt RNA-interferens eller RNAi, som virker etter transkripsjonen for å kontrollere genuttrykk. De to hovedtypene av små RNA er mikro-RNA eller miRNA og små forstyrrende RNA eller siRNA. Disse molekylene regulerer i utgangspunktet genuttrykket ved å undertrykke målgenet. Både miRNA og siRNA har veldig like biogeneseveier, selv om det er noen forskjeller mellom dem. Opprinnelsen til miRNA og siRNA er fra dsRNA-molekyler. Modne miRNA-er ligner strukturelt på siRNA-molekyler.
miRNA
Mikro-RNA eller miRNA er de små RNA-molekylene som formidler den siste kontrollen i translasjonsgenregulering. Deregulering av miRNA kan føre til kreft og annen sykdomsutvikling. Derfor er riktig regulering av informasjon kodet i den ikke-kodende regionen til miRNA svært kritisk i mange grunnleggende cellulære prosesser.
siRNA
siRNA er også referert til som kort interfererende eller lyddempende RNA og består av dobbelttrådet RNA med 20 til 25 basepar. Hovedrollen til siRNA er å forstyrre uttrykket av spesifikke gener med komplementære nukleotidsekvenser. siRNA består av kort dobbelttrådet RNA med fosforylerte 5'-ender og hydroksylerte 3'-ender med to overhengende nukleotider.
Hva er forskjellen mellom siRNA og miRNA?
• miRNA avledet fra spesifikke genomiske loci, mens siRNA avledet fra mRNA, transposoner, virus eller heterokromatisk DNA.
• Syntese av miRNA blir behandlet fra lengre forløper-hårnålstranskripsjoner (primær nukleær miRNA-sekvens av RNase III-endonuklease), mens den av siRNA behandlet fra lange bimolekylære RNA-duplekser.
• Hvert miRNA-hårnålsforløpermolekyl produserer enkelt miRNA-dupleks, mens hvert siRNA-forløpermolekyl produserer flere siRNA-duplekser.
• siRNA-sekvenser er sjelden konserverte, mens miRNA-sekvenser er godt konserverte.
• Alle baser i siRNA bidrar til dens målspesifisitet, mens bare 5' halvparten av miRNA bidrar til dens målspesifisitet.
• miRNA binder seg ofte til den 3' uoversatte regionen av måltranskripsjoner, mens siRNA-er danner komplementær dupleks hvor som helst langs et mål-mRNA.
• miRNA spesifiserer «hetero- silencing» mens siRNA brukes for «auto silencing».
• miRNA fungerer som et signal for å forhindre oversettelse, mens siRNA fysisk forhindrer oversettelse.
