Nøkkelforskjellen mellom protomerer og kapsomerer er at protomerer er strukturelle enheter av oligomere proteiner, mens kapsomerer er individuelle proteiner sammensatt av protomerer, som er strukturelle underenheter av det virale kapsidet.
Et virus er en intracellulær obligat parasitt, som er en smittsom partikkel. Kapsiden er en av de to hovedkomponentene i en viruspartikkel. Det er en proteinkappe som omgir og beskytter det virale genomet. Et kapsid består av protomerer, som er de strukturelle enhetene til oligomere proteiner. Capsomere er en strukturell underenhet av det virale kapsidet, og det er en aggregering av flere protomerer som en enhet. Dermed monterer protomerer seg selv for å danne en kapsomer og kapsomerer monterer seg selv for å danne en kapsid.
Hva er Protomers?
Protomerer er de strukturelle enhetene til oligomere proteiner. Protomer inneholder minst to forskjellige polypeptidkjeder. Oftere inneholder de flere polypeptider. I virale kapsider samler protomerer seg selv for å danne kapsomerer, som er de morfologiske enhetene til kapsider. Protomere kobles til hverandre via spesifikke bindinger og monterer seg selv.
Figur 01: Protomers
I tobakksmosaikkviruset samler protomerer seg for å danne en to-lags skive for å pakke inn RNA-genomet. Dermed danner disse protomerne av tobakksmosaikkvirus til slutt et langt stivt hult rør, som gir det et spiralformet utseende. I ikosaedrisk symmetri samler protomerer seg til enheter på fem eller seks kapsomerer og kondenserer deretter til 20 flater med likesidede trekanter og 20 topper.
Hva er Capsomeres?
Kapsomerer er de strukturelle proteinunderenhetene til den virale kapsiden. De er også de morfologiske underenhetene til virus. Strukturelt er kapsiden en samling av kapsomerer. Hver kapsomere har flere protomerer selvmontert med hverandre. Dessuten er kapsomerer anordnet annerledes i kapsiden for å gi en form til den virale kapsiden. I denne forbindelse er spiralformet, ikosaedrisk og kompleks de tre typene kapsomere-arrangementer i virus. Imidlertid er arrangementet av kapsomerer karakteristisk for et bestemt virus. Kapsomerer går sammen via interkapsomere triplekser som består av to kopier av ett protein og en kopi av et annet.
Figur 02: Capsomeres
I tillegg har hvert virus et begrenset antall kapsomerer. Hepatitt B-virus har et ikosaedrisk kapsid som inneholder 180 kapsomerer. Rekombinant adenovirus har et kapsid som inneholder 252 kapsomerer. Herpesvirus har 162 kapsomerer i kapsidene. Dessuten har enterovirus 60 kapsomerer i kapsid. På samme måte har forskjellige virus et forskjellig antall kapsomerer i proteinskallet.
Capsomeres fyller flere funksjoner i virus. Kapsomerer beskytter det virale genomet mot fysiske, kjemiske og enzymatiske skader. Dessuten er kapsomerer viktige for å introdusere et vir alt genom i verten ved å adsorbere lett til vertscelleoverflater.
Hva er likhetene mellom protomerer og kapsomere?
- Protomerer og kapsomerer er proteinstrukturer.
- Protomerer er underenheter av kapsomerer, mens kapsomerer er underenheter av det virale kapsidet.
- Både protomerer og kapsomerer kan selvmontere.
Hva er forskjellen mellom Protomers og Capsomeres?
Protomerer er de strukturelle enhetene som lager oligomere proteiner, mens kapsomerer er de morfologiske enhetene til virale kapsider. Så dette er nøkkelforskjellen mellom protomerer og kapsomerer. Videre aggregerer protomerer for å danne kapsomerer, mens kapsomerer aggregerer for å danne kapsid.
Infografikken nedenfor oppsummerer forskjellen mellom protomerer og kapsomerer.
Sammendrag – Protomers vs Capsomeres
Protomerer er underenheter av kapsomerer mens kapsomerer er proteinunderenheter av det virale kapsidet. Dermed er kapsomer en aggregering av protomerer mens kapsid er en aggregering av kapsomerer. Arrangement av protomerer eller arrangement av kapsomerer gir form eller symmetri til et bestemt virus. Basert på kapsomere-arrangement, er spiralformet og icosahedral to former eller symmetrier sett i virus. Så dette oppsummerer forskjellen mellom protomerer og kapsomerer.
