Nøkkelforskjellen mellom konservert og konsensussekvens er at konservert sekvens refererer til lignende sekvenser av nukleinsyrer eller aminosyrer som forekommer i forskjellige eller samme arter over generasjoner, mens konsensussekvens er en vanlig påtruffet nukleotidsekvens eller aminosyresekvens funnet i en svært konservert region med DNA eller RNA eller protein.
Organismer deler like og forskjellige egenskaper. Når man studerer forholdet mellom organismer og klassifiserer dem, er genom eller genetisk sammensetning av organismer veldig viktig. Det er noen nukleotid- eller aminosyresekvenser som er vanlige blant forskjellige organismer. En konservert sekvens er en nukleinsyre- eller aminosyresekvens som er konsistent mellom arter. Derfor er de fylogenetisk viktige når de genererer fylogenetiske trær. I konserverte sekvenser er det spesifikke nukleotidsekvenser som er mer vanlig å finne. De er kjent som konsensussekvenser.
Hva er bevart sekvens?
En konservert sekvens er en nukleinsyresekvens eller aminosyresekvens som er lik blant arter. Derfor er den konsistent på tvers av arten gjennom evolusjonen. Generelt opprettholdes disse sekvensene av naturlig utvalg. De forblir uendret langt opp i det fylogenetiske treet. Derfor er konserverte sekvenser viktige for å konstruere fylogenetiske trær. Det antas at svært konserverte sekvenser ofte har en viktig funksjonell verdi. De er også nyttige for å identifisere genetiske sykdommer. Imidlertid kan konserverte sekvenser være kodende eller ikke-kodende nukleinsyresekvenser. I tillegg viser konserverte sekvenser langsommere mutasjonshastigheter. Derfor viser de svært minimale endringer i sammensetningen; noen ganger viser de ikke endringer gjennom generasjonene.
Figur 01: Bevart sekvens
RNA-komponenter av ribosomer er til stede i alle livets domener, homeobox-sekvensene i eukaryoter og tmRNA i bakterier er flere eksempler på svært konserverte sekvenser. Identifikasjon av konserverte sekvenser er enkelt når bioinformatikktilnærminger, spesielt sekvensjusteringsverktøyet, brukes. Dessuten letter multippelsekvensjustering visualisering av konserverte sekvenser.
Hva er konsensussekvens?
En konsensussekvens er en sekvens som vanligvis finnes i en gitt konservert region av DNA eller RNA. Det er en veldig spesifikk nukleotidsekvens. Som et eksempel er det en konsensussekvens ved -10 som TATAAT (Pribnow-boks) i E. coli-promotere, som er svært konserverte sekvenser. På samme måte er det en annen konsensussekvens: TTGACA i E. coli-promotere ved -35 også. Konsensussekvenser er også kjent som «bokser».
Figur 02: Konsensussekvens
I tillegg til DNA og RNA har proteiner også konsensussekvenser av aminosyrer. Proteinbindingsseter er ofte representert ved konsensussekvenser. Restriksjonsenzymer har også konsensussekvenser. Dessuten er spleisesteder også konsensussekvenser. I likhet med konserverte sekvenser kan konsensussekvenser beregnes og visualiseres med bioinformatikkverktøy.
Hva er likhetene mellom bevart og konsensussekvens?
- Konserverte og konsensussekvenser er nukleinsyre- eller aminosyresekvenser som er vanlige på tvers av arter.
- Både konserverte sekvenser og konsensussekvenser kan visualiseres med bioinformatikkverktøy.
- De er mye brukt i molekylærbiologi.
Hva er forskjellen mellom bevart og konsensussekvens?
Den konserverte sekvensen er en nukleinsyre- eller aminosyresekvens som er konsistent blant arter, mens konsensussekvenser er veldig spesifikke og ofte funnet baser eller aminosyrer i en gitt konservert region. Så dette er nøkkelforskjellen mellom konservert og konsensussekvens. Dessuten er en annen forskjell mellom konserverte og konsensussekvenser at de konserverte sekvensene er fylogenetisk viktige mens konsensussekvenser ofte er proteinbindingsseter, spleisesteder, restriksjonsenzymskjæringsseter, etc.
Summary – Conserved vs Consensus Sequence
Konserverte sekvenser er sekvenser av nukleinsyrer eller proteiner som er like blant levende arter. En promoter, ribosombindingssted, et replikasjonsopphav og aminosyresekvens for histonprotein er flere eksempler på konserverte sekvenser. I kontrast er konsensussekvenser spesifikke baser eller aminosyrer som oftere finnes i en gitt konservert sekvens. -10 bokser, -35 bokser med E. coli-promoter, proteinbindingsseter, spleisesteder og restriksjonsenzymer som gjenkjenner steder er flere eksempler på konsensussekvenser. Dermed er dette sammendraget av forskjellen mellom bevart og konsensussekvens.
