Nøkkelforskjell – Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree
Fylogeni er et viktig felt som utforsker livet på jorden gjennom tiden. Den avslører sammenhengen mellom organismer med deres forfedre og etterkommere. Relasjonene mellom organismer er diagrammatisk representert av ulike trelignende representasjoner som dendogram, kladogram, fenogram, fylogram, etc. Et fylogenetisk tre er et forgrenende trelignende diagram som forklarer de fylogenetiske relasjonene mellom organismer med mengden evolusjonær avstand. Det er to hovedtyper av fylogenetiske trær kjent som rotfestede og uberørte. Den viktigste forskjellen mellom det rotfestede og ikke-rotfestede fylogenetiske treet er at det rotfestede treet viser den mest basale stamfaren til treet, mens det ikke-rotede fylogenetiske treet ikke viser en forfedres rot.
Hva er et rotfestet fylogenetisk tre?
Et rotfestet fylogenetisk tre fungerer som et nyttig diagram som viser evolusjonshistorien. Den har en basal node som kalles roten, som representerer den felles stamfaren til alle gruppene i treet. Roten til et tre regnes som det eldste punktet i treet som representerer den siste felles stamfaren til alle grupper som er inkludert i treet. Derfor viser et rotfestet tre retningen til evolusjonær tid. Fra en enkelt art av et rotfestet tre kan felles aner eller artens stamfar finnes ved å spore tilbake til basalknuten. Siden det rotfestede treet viser retningen av evolusjonær tid, er det lett å finne de eldre eller nyere gruppene det har. Et rottre kan brukes til å studere hele gruppene av organismer. Nøyaktig roting av et fylogenetisk tre er en viktig og avgjørende faktor siden unøyaktig roting kan resultere i feil tolkninger av genetiske endringer mellom organismer og deres retningsbestemmelse i evolusjonen.
Figur 01: Et rotfestet fylogenetisk tre
Hva er et urotet fylogenetisk tre?
Et fylogenetisk tre uten rot er et fylogenetisk diagram som mangler en felles stamfar eller en basal node. Denne typen tre indikerer ikke opprinnelsen til utviklingen av interessegruppene. Den viser bare forholdet mellom organismer uavhengig av retningen på den evolusjonære tidslinjen. Derfor er det vanskelig å studere de evolusjonære forholdene til gruppene med hensyn til tid ved å bruke et tre uten rot.
Det er to hovedmåter å rote et fylogenetisk tre uten rot. De er
Finne en utgruppe – Dette krever forkunnskaper om forholdet mellom taxa. Deretter kan et takson som ligger utenfor gruppen brukes som en utgruppe for å tegne et rotfestet fylogenetisk tre
Finne midtpunktet eller avstanden – Midtpunktet til de to fjerneste taxaene i treet kan antas som en rot for det fylogenetiske treet
Figur 02: Et urotet fylogenetisk tre
Hva er forskjellen mellom rotfestet og urotet fylogenetisk tre?
Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree |
|
| Et rotfestet fylogenetisk tre er et diagram som viser den siste felles stamfaren til gruppene. | Et urotet fylogenetisk tre viser forholdet mellom organismer uten å vise den felles stamfaren. |
| Node | |
| Den har en node (root). | Den har ikke en node. |
| Evolutionsretning | |
| Den har en retning for å indikere utviklingstiden. | Det spesifiserer ikke et evolusjonært forhold. |
| Holdning til andre | |
| Treet gjør det mulig å bestemme forholdet mellom forfedre og etterkommere mellom grupper. | Treet tillater ikke å snakke om slektskap mellom stamfar og etterkommer. |
Sammendrag – rotfestet vs urotet fylogenetisk tre
Et fylogenetisk tre representerer evolusjonsveiene og forbindelsene mellom organismer ved å bruke et forgrenet trelignende diagram. Fylogenetisk lokke kan være rotfestet eller uten rot. Et rotfestet tre har en node ved basen, som representerer den felles stamfaren som forbinder alle interessegrupper. Et tre uten røtter viser forholdet mellom organismer. Den skildrer imidlertid ikke den felles stamfaren som alle gruppene deler. Dette er forskjellen mellom rotfestet og ikke-rotet fylogenetisk tre.
