Key Difference – Metabolomics vs Metabonomics
Metabolitter er de små molekylene som er involvert i metabolske reaksjoner i cellene. Metabolitter inkluderer metabolske mellomprodukter, hormoner, sekundære metabolitter, signalmolekyler, etc. De er de fungerende molekylene for biokjemiske reaksjoner i cellene. Et komplett sett med metabolitter av en biologisk prøve eller en enkelt organisme er kjent som metabolom. Metabolom er en dynamisk samling som endres hvert sekund i kroppen. Metabolomikk og metabonomikk er to begreper relatert til studiet av metabolom til en organisme. Den viktigste forskjellen mellom metabolomics og metabonomics er at metabolomics er mer opptatt av normal endogen metabolisme og metabolsk profilering på cellulært eller organnivå, mens metabonomics er mer opptatt av å utvide metabolomics med informasjon om forstyrrelser av metabolisme på grunn av miljøfaktorer, sykdommer, tarm. mikroorganismer og sammenligne metabolsk profilering, etc. Metabolomics er hovedsakelig drevet av massespektrometri, og metabonomics bruker NMR-spektroskopi for metabolittanalyse.
Hva er Metabolomics?
Metabolomics er studiet av metabolske prosesser som skjer i celler, biovæsker, vev eller organismer. Det inkluderer identifisering og kvantifisering av cellulære metabolitter ved bruk av gode analytiske og statistiske verktøy. Metabolomics anses som en viktig studie siden den avslører informasjon om metabolismen til en organisme.
For å studere substrater og produkter av metabolske reaksjoner, bruker metabolomics massespektrometri som en analytisk plattform. Massespektrometri avslører typer metabolitter og deres konsentrasjoner, som gjenspeiler den faktiske biokjemiske tilstanden til cellene eller vevet. Derfor kan metabolomikk betraktes som den beste representanten for molekylær fenotype av en organisme. Metabolomics er en omic teknologi av små molekyler av organismer og sammenlignet med andre omic studier; metabolomikk er svært viktig siden den direkte gjenspeiler den nåværende statusen til den biokjemiske reaksjonen til cellene.
Metabolomics kan også betraktes som en utvidelse av proteomics fordi de genereres på grunn av aktivitetene til enzymer som er proteiner som vist i følgende figur.
Figur 01: Metabolomics-skjema
Hva er Metabonomics?
Metabonomikk er definert som en kvantitativ måling av multiparametriske metabolske responser på spesifikke tidspunkter i forhold til patofysiologiske belastninger eller genetisk modifikasjon. Dette brukes vanligvis på studier utført om menneskelig ernæring og reaksjoner på medikamenter eller sykdom. Denne tilnærmingen ble utviklet av Jeremy Nicholson ved Imperial College, London, og den har blitt brukt på en rekke felt, inkludert toksikologi, sykdomsdiagnose, ernæring, etc. Historisk sett var metabonomics en av de første metodene for å anvende omfanget av systembiologi på studier av stoffskiftet.
Metabonomics er mer opptatt av å sammenligne biokjemiske profiler i stedet for å identifisere individuelle metabolske forbindelser i metabolomics. Derfor kan metabonomikk defineres som en undergruppe av metabolomikk. Den legger i hovedsak vekt på sammenligning av metabolske profiler til ulike populasjoner med hensyn til sykdommer, miljøbelastninger, genmodifikasjoner, ernæring, legemidler osv. fordi metabolitter er de gode markørene som signaliserer sykdomstilstander, effekter av legemidler, miljøbelastninger, eksponering for giftstoffer. osv.
Metabonomiske studier avslører både intracellulære og ekstracellulære metabolitter. Den bruker høykapasitetsteknikker for å analysere et stort antall metabolitter samtidig og gjentatte ganger, noe som muliggjør tidsmessig undersøkelse av den fysiologiske statusen til cellene. Det avslører også sammenhengen mellom metabolitter og patologisk status til organismen. For å støtte metabonomiske studier kan genomikk og proteomikk brukes siden de henger sammen som vist i figuren ovenfor.
Hva er forskjellen mellom Metabolomics og Metabonomics?
Metabolomics vs Metabonomics |
|
| Metabolomics er studiet av hele settet med metabolitter til en organisme | Metabonomics er den kvantitative studien av multiparametriske metabolske responser fra levende systemer i temporal basis til patofysiologiske stimuli eller genetisk modifikasjon. |
| Main Concern | |
| Metabolomics er mer opptatt av metabolsk profilering og identifisering av individuelle metabolitter som finnes i cellene. | Metabonomics er mer opptatt av å sammenligne metabolitter eller metabolske profiler av populasjoner i forhold til genetiske modifikasjoner, sykdommer, miljøbelastninger, patologiske stimuli, medikamenter osv. |
| Information | |
| Metabolomics er hovedsakelig fokusert på endogen metabolisme. | Metabonomics er ikke begrenset til endogen metabolisme. Den strekker seg til å finne informasjon om forstyrrelser i metabolismen forårsaket av interne og eksterne faktorer som kostholdsmønstre, giftstoffer, sykdomsprosesser osv. |
| Analytiske verktøy | |
| Den bruker massespektrometri som den viktigste analytiske plattformen | Metabonomics bruker NMR-spektroskopi som den viktigste analytiske plattformen. |
Sammendrag – Metabolomics vs Metabonomics
Metabolom representerer det komplette settet med små molekyler k alt metabolitter som finnes i en celle eller i en organisme. Metabolomics er studiet av hele metabolomet for å generere den metabolske profilen. Metabolomics lar forskere måle den faktiske fysiologiske statusen til cellen eller organismen. Metabonomics er en del av metabolomics som strekker seg til å trekke ut informasjon om de multiparametriske metabolske responsene til levende systemer på patofysiologiske stimuli og genetiske modifikasjoner. Metabonomics er ikke bare opptatt av individuell metabolsk profilering som metabolomics; den sammenligner metabolske profiler i forhold til andre faktorer som miljøbelastninger, sykdommer, toksiner osv. Både metabolomics og metabonomics involverer studier av metabolitter av organismene for å måle den faktiske fysiologiske statusen til cellene. Derfor blir disse to noen ganger betraktet som synonymer, uten å ta hensyn til forskjellen mellom metabolomics og metabonomics.
