Nøkkelforskjell – eukaryote vs prokaryote promotere
Transkripsjon er prosessen med å konvertere den genetiske informasjonen som er lagret i den kodende DNA-sekvensen til mRNA-sekvens. En spesifikk DNA-region lokalisert i 5'-enden av transkripsjonsenheten starter denne prosessen. Den regionen er kjent som promoterregionen. Disse promoterene finnes vanligvis ved siden av transkripsjonsstartstedet. Lengden på en promoter varierer fra 100 bp til 1000 bp. Promotorer er forskjellige avhengig av typen organisme. Eukaryote og prokaryote promotorer er forskjellige fra hverandre. I prokaryoter finnes bare tre typer promotorsekvenser, nemlig -10 promotorer, -35 promotorer og oppstrømselementer. I eukaryoter er det mange forskjellige promoterelementer som TATA-boks, initiatorelementer, GC-boks, CAAT-boks osv. Dette er nøkkelforskjellen mellom eukaryote og prokaryote promotere.
Hva er eukaryote promotere?
Tre hovedporsjoner; kjernepromoter, proksimal promoter og distal promoter, danner til sammen en promoter. I sammenheng med eukaryoter finnes det mange antall promoterelementer som er svært sofistikerte og mer forskjellige enn promotere. Det har blitt funnet ut at på grunn av denne kompleksiteten til de eukaryote promoterene, har DNA-et evnen til å folde seg tilbake på seg selv. Dette forklarer også det faktum at effekten av mange regulatoriske sekvenser finner sted selv om de er lokalisert mange kilobaser unna transkripsjonsstedet. Disse eukaryote promoterene har evnen til å spenne gjennom et bredt spekter av DNA-sekvenser.
Figur 01: Eukaryotic Promoter
Eksempler på noen eukaryote promotere er Pribnow-boks (TATA-boks), GC-boks, CAAT-boks osv. I sammenheng med TATA-boks er det en sekvens av 5' – TATAA -3' som er tilstede i kjernen promoter regionen. Til TATA-boksen er transkripsjonsfaktorproteiner og histonproteiner bundet. Bindingen av transkripsjonsfaktorproteiner til TATA-boksen hjelper til med bindingen av RNA-polymerase, som deretter resulterer i dannelsen av transkripsjonskompleks. Enkelt sagt vil bindingen av disse proteinene drive transkripsjonsprosessen. Denne prosessen vil bli hemmet når histonproteiner blir bundet til TATA-boksen. Derfor er TATA-boksen et viktig promoterelement som involverer regulering av hastigheten på eukaryotisk transkripsjon.
Hva er prokaryote promotere?
I prokaryote organismer identifiseres promotoren som involverer i transkripsjon av den assosierte faktoren k alt sigma-faktor. Sigma-faktorer er unike for forskjellige promotersekvenser. Derfor sies det at hver enkelt sigma-faktor vil gjenkjenne en enkelt kjernepromotorsekvens. Dette er en unik egenskap som er til stede i den prokaryote transkripsjonsprosessen. Både RNA-polymerase og sigma-faktoren identifiserer til sammen den korrekte promoterregionen og danner transkripsjonskomplekset.
Den prokaryote promoteren inneholder bare tre typer promoterelementer. Jo mindre involvering av promotorelementer i prokaryoter er hovedårsaken til at deres transkripsjonsprosess er mindre sofistikert sammenlignet med eukaryotisk transkripsjon som involverer et høyere antall promotorsekvenser. Av de tre promotorelementene til prokaryoter er det to hovedviktige to korte DNA-sekvenser. Disse sekvensene er klassifisert i henhold til deres plassering. De er -10 promotere eller element (som er tilstede 10bp oppstrøms for transkripsjonsstartstedet), -35 promotere eller element (som er tilstede 35bp oppstrøms for transkripsjonsstartstedet).
Figur 02: Prokaryotic Promoter
-10-promotoren tilsvarer den eukaryote TATA-boksen eller Pribnow-boksen og er en essensiell komponent for initiering av transkripsjon i prokaryoter. -35-promotoren består av en sekvens som er TTGACA som aktivt involverer i reguleringen av hastigheten på prokaryot transkripsjon.
Hva er likhetene mellom eukaryote og prokaryote promotere?
- I begge typer styres promoterene av forskjellige DNA-regulatoriske sekvenser som inkluderer forsterkere, lyddempere, isolatorer og grenseelementer.
- Promotorer er sekvensene som initierer transkripsjon i prokaryoter og eukaryoter.
- Promotorer er DNA-sekvenser.
Hva er forskjellen mellom eukaryote og prokaryote promotere?
Eukaryote vs Prokaryote Promoters |
|
| Eukaryote promotere er de regulatoriske sekvensene som initierer transkripsjonen av eukaryote organismer. | Prokaryote promotere er de regulatoriske sekvensene som initierer transkripsjonen av prokaryote gener. |
| Elements | |
| Prokaryot promoter består av oppstrømselementer, -10 element og -35 elementer. | Eukaryot promoter består av Pribnow-boks (TATA-boks), CAAT-boks, GC-boks og initiatorelementer. |
Sammendrag – eukaryote vs prokaryote promotere
En promoter er en region av DNA som involverer initiering av prosessen som kalles transkripsjon. Disse promoterene finnes vanligvis oppstrøms til transkripsjonsstartstedet. De tre hoveddelene som danner en promoter er core promoter, proksimal promoter og distal promoter. I sammenheng med eukaryoter er det mange promoterende elementer i promoterregionen som er svært sofistikerte og mer mangfoldige enn prokaryoter. Eksempler på noen eukaryote promotorelementer er Pribnow-boks (TATA-boks), GC-boks, CAAT-boks osv. I prokaryoter er det to viktige promotorelementer, nemlig -10 element (som er tilstede 10bp oppstrøms for transkripsjonsstartstedet), -35 elementer (som er tilstede 35bp oppstrøms for transkripsjonsstartstedet). -10-promoteren initierer transkripsjonen, og -35-promotoren regulerer transkripsjonen. Begge typer promotorer kontrolleres av forskjellige DNA-regulerende sekvenser som inkluderer forsterkere, lyddempere, isolatorer og grenseelementer. Dette er forskjellen mellom eukaryote og prokaryote promotere.
Last ned PDF-en av Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters
Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til offline-formål i henhold til sitat. Last ned PDF-versjonen her: Difference Between Eukaryotic and Prokaryotic promoter
