Nøkkelforskjellen mellom PARP1 og PARP2 er at plante- og dyre-PARP1 bærer Zn-finger DNA-bindende motiver mens plante PARP2 bærer N-terminale SAP DNA-bindende motiver.
Poly ADP-ribosepolymerase (PARP) er en familie av proteiner som er nukleære enzymer. Det er 17 forskjellige typer PARP-enzymer i PARP-familien. PARP1 og PARP2 er to enzymer som er essensielle for normale DNA-reparasjonsaktiviteter.
Hva er PARP?
PARP (Poly ADP-ribosepolymerase) er en familie av proteiner som tjener i en rekke cellulære prosesser som DNA-reparasjon, genomisk stabilitet og programmert celledød. De katalyserer en prosess k alt ADP-ribosylering. ADP-ribosylering refererer til tilsetning av ADP-riboseenheter fra nikotinamidadenindinukleotid (NAD) til målsubstrater for å reparere DNA-trådbruddene.
PARP-enzymer er DNA-bindende proteiner. De aktiveres av hakkene som finnes i DNA-molekyler. Når de binder seg med DNA-brudd, hydrolyserer de NAD+ til nikotinamid og fremmer polymeriseringen av ADP-ribosen. Derfor deltar PARP kjernefysiske enzymer i DNA-reparasjon. Dessuten fungerer poly-ADP-ribosylering som en post-translasjonell modifikasjon som spiller en nøkkelrolle i replikasjon, transkripsjonsregulering, vedlikehold av telomerer og proteinnedbrytning. PARP-enzymer deltar også i vedlikehold av genomstabilitet, regulering av kromatinstruktur, celleproliferasjon og apoptose.
Hva er PARP1?
PARP1 er medlem av PARP-proteinfamilien. Det er det første og best karakteriserte proteinet i denne familien. Den fungerer som en første responder som oppdager DNA-skader og deretter letter valget av reparasjonsmekanisme. Dessuten regulerer PARP1 reparasjon av enkeltstrengede DNA-skader.
Figur 01: PARP1
I tillegg til å reparere enkeltstrengs DNA-brudd, regulerer PARP1 replikasjonsgaffelprogresjon og omstart. Videre fremmer den alternativ ikke-homolog sluttsammenføyning.
Hva er PARP2?
PARP2 er et annet medlemsprotein i PARP-proteinfamilien. Det er nært beslektet med PARP1-enzym. Genet PARP2 koder for PARP2-protein hos mennesker. PARP2 har et katalytisk domene, men mangler N-termin alt DNA-bindende domene. PARP-hemmere mot kreft kan hemme PARP2, på samme måte som PARP1.
Figur 02: PARP2
I planter, spesielt i Arabidopsis thaliana, spiller PARP2 en betydelig rolle i beskyttende respons på DNA-skade og bakteriell patogenese enn PARP1.
Hva er likhetene mellom PARP1 og PARP2?
- PARP1 og PARP2 er to typer kjernefysiske enzymer.
- De bruker NAD+ som substrat for å katalysere poly ADP-ribosylering.
- Begge aktiveres av DNA-enkeltstrengsbrudd.
- Pattedyr PARP1 og PARP2 er lokalisert i kjernen.
- Både PARP1 og PARP2 samhandler med kromatin.
- De reparerer DNA-skader.
- Noen PARP-hemmere anti-kreftmedisiner rettet mot PARP1 hemmer også PARP2.
Hva er forskjellen mellom PARP1 og PARP2?
PARP1 er et medlem av PARP-proteinfamilien som har et katalytisk domene og N-termin alt DNA-bindende domene mens PARP2 er et medlem av PARP-familien som mangler N-termin alt DNA-bindende domene. Den viktigste forskjellen mellom PARP1 og PARP2 er at plante- og dyre-PARP1 bærer Zn-finger DNA-bindende motiver mens plante PARP2 bærer N-terminale SAP DNA-bindingsmotiver.
Følgende infografikk oppsummerer forskjellen mellom PARP1 og PARP2.
Sammendrag – PARP1 vs PARP2
PARP er kjernefysiske enzymer som registrerer DNA-skader og reparerer dem. PARP1 og PARP2 er to av dem som er nært beslektet. Begge enzymene har et katalytisk domene. Men PARP2 mangler N-termin alt DNA-bindende domene som er tilstede i PARP1. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom PARP1 og PARP2. Begge typer enzymer bruker NAD+ som substrat.
