Nøkkelforskjellen mellom transkripsjonell og posttranskripsjonell gendemping er at transkripsjonell gendemping er reguleringen av genuttrykk på transkripsjonsnivå for å redusere RNA-syntese ved promoterdemping, mens posttranskripsjonell gendemping er reguleringen av genuttrykk ved translasjon nivå ved sekvensspesifikk RNA-nedbrytning.
Gendemping er prosessen med å regulere genuttrykk ved å avbryte eller undertrykke genuttrykk. Den slår av visse typer gener. Derfor forhindrer det produksjonen av et protein fra dets tilsvarende gen. Gendemping kan skje under transkripsjon eller oversettelse. Derfor er det to typer gendemping som transkripsjonell gendemping og posttranskripsjonell gendemping. Transkripsjonell gendemping reduserer RNA-syntese mens posttranskripsjonell gendemping degraderer mRNA. Dessuten foregår transkripsjonell gentilpasning i kjernene, mens posttranskripsjonell gendemping finner sted i cytoplasmaet.
Hva er transkripsjonell gendemping?
Transkripsjonell gendemping er gendemping som virker gjennom redusert RNA-syntese. Det er et resultat av histonmodifikasjon, og skaper et miljø som er utilgjengelig for transkripsjonsmaskineri. Dette skjer i cellekjernene. DNA-metylering er veldig viktig for transkripsjonell gendemping fordi metyleringen av promotersekvensen skjer under transkripsjonell gendemping. Metylering av kodende sekvens påvirker ikke transkripsjonen. Men metyleringen av promotersekvenser resulterer i promoterinaktivering på grunn av histondeacetylering og kromatinkondensering. Når promotorene er stilnet, påvirker det gentranskripsjon. Ved transkripsjonell gendemping blir derfor promotorene stilnet for å regulere genuttrykk på transkripsjonsnivå.
Figur 01: Gendemping
Hva er posttranskripsjonell gendemping?
Posttranskripsjonell gendemping, også kjent som RNA-demping eller RNA-interferens, er en type gendemping som fungerer gjennom sekvensspesifikk nedbrytning av RNA. Selv om transkripsjonen av genet ikke påvirkes, stopper proteinsyntesen fra mRNA på grunn av ustabil eller utilgjengelig mRNA. Posttranskripsjonell gendemping induseres av bevisst produksjon av dobbelttrådet RNA. Dobbelttrådet RNA utløser sp altningen av homologt mRNA. Små interfererende RNA-er som har homologe sekvenser til transkriberte områder av gener styrer den sekvensspesifikke nedbrytningen av mRNA. RNAi binder seg til den komplementære delen av mål-mRNA og merker det for nedbrytning.
Figur 02: Posttranskripsjonell gendemping
Posttranskripsjonell gendemping har flere bruksområder, inkludert genterapi og kreftbehandling. Posttranskripsjonell gendemping er en av de naturlige forsvarsmekanismene i planter mot invaderende RNA-virus. Derfor er planter som er defekte etter transkripsjonell gendemping mer utsatt for infeksjoner med RNA-virus.
Hva er likhetene mellom transkripsjonell og posttranskripsjonell gendemping?
- De er to distinkte gendempende fenomener.
- Begge fenomener kan induseres av dsRNA.
- For begge typer lyddemping finnes det små RNA-arter, som antas å være dsRNA-nedbrytningsprodukter.
- De er mekanisk beslektet.
Hva er forskjellen mellom transkripsjonell og posttranskripsjonell gendemping?
Transkripsjonell gendemping er et gendempingsfenomen som opererer på transkripsjonsnivå via redusert RNA-syntese. På den annen side er posttranskripsjonell gendemping et gendempingsfenomen som oppstår på translasjonsnivå via sekvensspesifikk nedbrytning av mRNA. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom transkripsjonell og posttranskripsjonell gendemping.
Dessuten forekommer transkripsjonell gendemping i kjernene mens posttranskripsjonell gendemping forekommer i cytoplasmaet. Dessuten er promotorer inaktivert i transkripsjonell gendemping mens promotorer er aktive i posttranskripsjonell gendemping.
Infografikk nedenfor viser flere forskjeller mellom transkripsjonell og posttranskripsjonell gendemping.
Sammendrag – transkripsjonell vs posttranskripsjonell gendemping
Genene er regulert på enten transkripsjonelt eller posttranskripsjonelt nivå. Transkripsjonell gendemping skjer i kjernene via promotorsekvensmetylering og histonmodifikasjon. Som et resultat avtar RNA-syntesen. Posttranskripsjonell gendemping skjer i cytoplasmaet gjennom sp altning av mRNA og hemming av translasjon. Begge fenomenene induseres av dsRNA og er avhengige av små forstyrrende RNA. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom transkripsjonell og posttranskripsjonell gendemping.
