Nøkkelforskjellen mellom NAAT og PCR er at NAAT er en som forsterker genetisk materiale ved hjelp av flere måter, inkludert polymerasekjedereaksjon, trådforskyvning eller transkripsjonsmediert amplifikasjon, mens PCR er en metode som forsterker genetisk materiale ved bruk av kun termisk sykling.
Patogener identifiseres hovedsakelig ved forsterkning av deres genetiske materiale. De fleste teknikkene i dette området fokuserer på påvisning av det genetiske materialet til patogenet ved å forsterke spesifikke sekvenser i sanntid. Derfor produseres resultatene veldig raskt i diagnostisk sammenheng. NAAT, PCR, biosensor og LCR er flere teknikker som brukes i laboratorier for å forsterke det genetiske materialet til patogenet.
Hva er NAAT?
Nukleinsyreamplifikasjonstest (NAAT) er en metode innen molekylærbiologi som ampliserer genetisk materiale ved hjelp av flere måter som polymerasekjedereaksjon, strengforskyvningsamplifikasjon eller transkripsjonsmediert amplifikasjon. Amplifisering av genetisk materiale kan også gjøres gjennom teknikker som en ligeringskjedereaksjon og forgrenet DNA-reaksjon (kvantipleks b DNA) i NAAT-prosedyren. NAAT bruker spesifisiteten til Watson-Crick baseparing. I NAAT-prosedyren hybridiseres en enkeltstrenget probe eller primermolekyl med mål-DNA- eller RNA-molekylet. Derfor er utformingen av probestrengen svært viktig for å øke sensitiviteten og spesifisiteten til deteksjonen. Deretter forsterker neste trinn i NAAT det genetiske materialet ved å lage mange kopier av det for påvisning.
Figur 01: NAAT
NAAT brukes for tiden for påvisning av flere patogener som Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis og SARS-COV2. I tillegg er NAAT-testen utviklet for å forkorte vindusperioden. Vindusperioden er tidsperioden mellom når en pasient har blitt smittet og når de viser seg som positive ved antistofftester. Videre ble NAAT-screeningsmetoden først godkjent i 1999 av FDA. NAAT har mange fordeler, inkludert påvisning av lave nivåer av DNA eller RNA, høy sensitivitet og høy spesifisitet.
Hva er PCR?
PCR er en metode innen molekylærbiologi som forsterker genetisk materiale ved kun å bruke termisk syklus. PCR står for polymerasekjedereaksjon. Det er en test for å oppdage genetisk materiale fra en spesifikk organisme som bakterier, sopp og virus. Ved sykdomsdiagnostikk oppdager PCR tilstedeværelsen av et patogen hvis personen har et patogen på tidspunktet for testen. Ved sykdomsdiagnose har PCR-protokollen flere trinn, inkludert prøveinnsamling, DNA-ekstraksjon, PCR og sekvensering. Ved testing av patogener brukes den innsamlede prøven til å trekke ut genetisk materiale (DNA eller RNA). PCR-prosedyren krever spesielle kjemikalier, primere og enzymer for å produsere millioner av kopier av genetisk materiale inne i PCR-maskinen k alt termisk syklus. Når det er amplifisert fra PCR-produktet, kan patogenet påvises. Forskere bruker spesiell programvare for å tolke resultatene.
Figur 02: PCR
I tillegg er det forskjellige typer PCR som brukes i forskningen. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD og Nested PCR er flere blant dem. PCR er spesielt nyttig ved påvisning av faryngitt (streptokokkfaryngitt), atypisk lungebetennelse (Chlymydia pneumoniae), meslinger (Morbillivirus), hepatitt (HBV) og ulcerøs urogenital infeksjon (Haemophilus ducreyi).
Hva er likhetene mellom NAAT og PCR?
- NAAT og PCR er to viktige molekylærbiologiske metoder som brukes til å forsterke genetisk materiale.
- Nukleinsyrer (DNA eller RNA) forsterkes med begge teknikkene.
- De er raske og raske teknikker.
- Begge teknikkene brukes for tiden for sykdomsdiagnose.
- De er dyre enn konvensjonelle metoder.
Hva er forskjellen mellom NAAT og PCR?
NAAT er en metode innen molekylærbiologi som forsterker genetisk materiale ved hjelp av flere metoder, mens PCR er en metode innen molekylærbiologi som forsterker genetisk materiale ved kun å bruke termisk syklus. NAAT bruker ulike teknikker for amplifikasjon av genetisk materiale som polymerasekjedereaksjon, amplifikasjon av trådforskyvning, transkripsjonsmediert amplifikasjon, ligeringskjedereaksjon og forgrenet DNA-reaksjon (kvantipleks b DNA). På den annen side bruker PCR forskjellige teknikker for amplifikasjon av genetisk materiale som RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. Så dette er hovedforskjellen mellom NAAT og PCR.
Infografien nedenfor presenterer forskjellene mellom NAAT og PCR i tabellform for side ved side-sammenligning.
Sammendrag – NAAT vs PCR
Det finnes ulike molekylærbiologiske verktøy som brukes i laboratorier for å forsterke genetisk materiale. NAAT, PCR, biosensor og LCR er flere slike teknikker. NAAT er en molekylærbiologisk teknikk som ampliserer genetisk materiale ved hjelp av flere måter som polymerasekjedereaksjon, trådforskyvning eller transkripsjonsmediert amplifikasjon. PCR er en metode innen molekylærbiologi som forsterker genetisk materiale ved hjelp av termisk syklus. Dermed er dette hovedforskjellen mellom NAAT og PCR.
