Nøkkelforskjellen mellom ORF og ekson er at ORF eller den åpne leserammen er en strekning av DNA-sekvens som begynner med translasjonsinitieringssted (startkodon) og slutter med translasjonstermineringssted (stoppkodon) mens ekson er en nukleotidsekvens i et gen som koder for aminosyrer.
En åpen leseramme er en del av en leseramme. Leserammer leses av ribosomer for å lage proteiner. ORF er en kontinuerlig strekning av kodoner som gir et fullt funksjonelt protein. Det begynner med et startkodon og avsluttes med et stoppkodon. Inne i ORF er det ingen stoppkodon som avbryter den kodende sekvensen. Oversettelse starter ved startkodon og slutter ved stoppkodon. Exon er en nukleotidsekvens av et gen. Den koder for aminosyrer i proteinet. Derfor er eksoner kodende regioner av et gen.
Hva er en ORF?
Åpen leseramme eller ORF er den kontinuerlige strekningen av en nukleotidsekvens som begynner med et startkodon og slutter med et stoppkodon. Med enkle ord refererer ORF til regionen av nukleotidsekvensen som ligger mellom start- og stoppkodonene. I mellom er det ingen stoppkodon som avbryter ORF. Nukleotidsekvensen mellom start- og stoppkodon koder for aminosyrer. Vanligvis er startkodon ATG mens stoppkodoner er TAG, TAA og TGA. ORF gir et funksjonelt protein når det transkriberes og oversettes. Derfor inkluderer ORF et startkodon, flere kodoner i midtregionen og et stoppkodon. Interessant nok har ORF en lengde som kan deles på tre.
Figur 01: ORF
I prokaryoter, siden det ikke er introner, er ORF den kodende regionen til et gen som transkriberer direkte til mRNA. I eukaryoter, siden det er introner, er ORF kodonsekvensen som resulterer etter prosessering eller RNA-spleising. ORF er et bevis som hjelper genprediksjon siden lange ORFer sannsynligvis er en del av et gen.
Hva er en Exon?
Eksoner er de kodende nukleotidsekvensene til gener som oversettes til proteiner. De er på hver side av et intron. Etter å ha fjernet ikke-kodende sekvenser fra pre-mRNA, består det modne mRNA-molekylet bare av eksonsekvenser. Deretter konverteres nukleotidsekvensen til det endelige RNA-molekylet (modent mRNA) til en aminosyresekvens av et spesifikt protein.
Figur 02: Exons
Nesten alle gener har en initial nukleotidsekvens som skiller den som et gen fra hoved-DNA- eller RNA-strengen, som er kjent som Open Reading Frame (ORF. I noen gener markerer to ORF-er hele genet og eksoner) er lokalisert innenfor den kodende sekvensen. Selv om det høres ut som om eksoner alltid uttrykkes i gener, er det tilfeller der intronsekvenser griper inn i eksonet for å forårsake mutasjoner, og denne prosessen er kjent som eksonisering.
Hva er likhetene mellom ORF og Exon?
- Både ORF og ekson er nukleotidsekvenser.
- Lang ORF og eksoner er deler av et gen.
- Begge har kodesekvenser.
Hva er forskjellen mellom ORF og Exon?
ORF og ekson er nukleotidsekvenser. ORF refererer til enhver strekning av DNA-sekvens lokalisert mellom et startkodon og et stoppkodon. I kontrast er eksonet en kodende nukleotidsekvens av et gen som koder for aminosyrer. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom ORF og exon. Eksoner er deler av et gen mens lang ORF sannsynligvis er en del av et gen. Dessuten er det introner på begge sider av et ekson, mens ORF ikke inkluderer introner.
Infografikken nedenfor oppsummerer forskjellen mellom ORF og ekson i tabellform.
Sammendrag – ORF vs Exon
Den åpne leserammen (ORF) er en del av leserammen. Det er den kontinuerlige strekningen av DNA-sekvensen som begynner med et startkodon og avsluttes med et stoppkodon. Exon er en nukleotidsekvens av et gen. Den koder for en del av mRNA-sekvensen. Derfor er eksoner deler av gensekvensen som uttrykkes i proteinet. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom ORF og exon.