Agarose vs polyakrylamid
Agarose og polyakrylamid er begge vannløselige polymerer, men mellom dem kan man se mange forskjeller, med utgangspunkt i deres opprinnelse. Både agarose og polyakrylamid har noe felles i deres evne til å danne porøse gelmatriser. Til tross for dette er det en rekke distinkte forskjeller mellom de to. De største forskjellene mellom begge disse polymerene ligger i deres opprinnelsesnatur, kjemiske struktur, deres forskjellige bruksområder og deres ytelse når det gjelder gelelektroforese.
Hva er Agarose?
Agarose er en naturlig forekommende lineær polymer som igjen er avledet fra en kompleks polymer k alt agar som finnes i tang. Agarose ekstraheres fra agar ved å fjerne dens proteinkomponent k alt agaropektin. Agarose er det som gir agar dens evne til å danne geler.
Den største bruken av agarose er i mikrobiologiske og molekylærbiologiske studier. I mikrobiologiske studier gir agarose, når det er supplert med passende næringsstoffer, en solid base for å dyrke mikroorganismer som bakterier og sopp. Når det brukes i halvfaste konsentrasjoner, kan det være nyttig for å vurdere motiliteten til disse mikroorganismene. I molekylærbiologi fungerer det som et viktig verktøy for en av de mest grunnleggende oppløsningsprosessene k alt 'gelelektroforese' eller 'agarosegelelektroforese' (AGE). Gelelektroforese er en prosess som tillater oppløsning eller separasjon av nukleinsyrer eller protein basert på deres størrelse og ladning. Her fungerer agarose som en porøs sillignende gel som separasjon skjer gjennom.
Agarose Structure
Hva er polyakrylamid?
Polyakrylamid er en syntetisk polymer og brukes i en rekke bransjer. Som tidligere nevnt, er bruken avhengig av dens evne til å danne geler. Men i tillegg til dette utnyttes dens evne til å holde på og drenere vann i forskjellige konsentrasjoner også i ulike bransjer.
Den mest utbredte og vanlige bruken av polyakrylamid er ved behandling av avløpsvann. Her brukes det som flokkuleringsmiddel for å fjerne suspendert organisk materiale; dermed forbedre turbiditeten og klargjøre vannet. En annen bruk av polyakrylamid er i papirindustrien. Her brukes den til enten å holde på eller drenere vann fra papirmassen etter behov. Tilsvarende brukes det i landbruks- og byggebransjen som jordforbedringsmiddel for å forhindre jorderosjon og forbedre kvaliteten.
I likhet med agarose brukes også polyakrylamid i molekylærbiologi som et viktig oppløsningsverktøy i en lignende prosess k alt "Polyakrylamidgelelektroforese" (PAGE). I tillegg til alt dette, brukes polyakrylamid også i malmbehandling og produksjon av flokkuleringsmiddel for å fjerne suspendert organisk materiale; dermed forbedre turbiditeten og klargjøre vannet. En annen bruk av polyakrylamid er i papirindustrien. Her brukes den til enten å holde på eller drenere vann fra papirmassen etter behov. Tilsvarende brukes det i landbruks- og byggenæringen som jordforbedringsmiddel for å forhindre jorderosjon og forbedre kvaliteten. I tillegg til alt dette, brukes polyakrylamid også i produksjon av mattilsetningsstoffer, myke kontaktlinser og tekstiler.
Polyakrylamidstruktur
Hva er forskjellen mellom agarose og polyakrylamid?
Opprinnelse av agarose og polyakrylamid:
Agarose: Agarose er en polymer av naturlig opprinnelse. Den er avledet fra tang.
Polyakrylamid: Polyakrylamid er av syntetisk opprinnelse og finnes ikke under noen naturlige omstendigheter.
Molekylær formel for agarose og polyakrylamid:
Agarose: Den molekylære formelen til agarose er C24H38O19.
Polyakrylamid: Den molekylære formelen til polyakrylamid er (C 3H5NO)n.
Kjemisk struktur av agarose og polyakrylamid:
Agarose: Agarose er et lineært polysakkarid. Den består av gjentatte disakkaridenheter k alt agrobiose holdt sammen av hydrogenbindinger.
Polyakrylamid: Polyakrylamid er en kjemisk tverrbundet polymer. Den består av akrylamidmonomerer og et tverrbindingsmiddel N,N’-metylenbisakrylamid.
Toksisitet av agarose og polyakrylamid:
Agarose: Både agarose og dens monomerenhet agrobiose er ikke-giftig av natur.
Polyakrylamid: Monomerenheten til polyakrylamid, akrylamid, er et antatt kreftfremkallende og kjent nevrotoksin, mens dens polymeriserte form er ikke-giftig av natur.
Kenskaper ved agarose- og polyakrylamidgeler:
AGE og PAGE:
Agarose: Agarosegelpreparat for AGE er mindre tidkrevende, enkelt og enkelt, og krever ingen initiator eller polymeriserende katalysator.
Polyakrylamid: Polyakrylamidgelpreparat for PAGE er tidkrevende og kjedelig og krever også en initiator (ammoniumpersulfat) og polymeriserende katalysator (N, N, N', N'-tetrametyletylendiamin – TEMED).
Nature:
Polyakrylamidgeler er kjemisk mer stabile enn agarosegeler.
porestørrelse:
Med samme konsentrasjon har polyakrylamidgelmatriser en tendens til å ha mindre porestørrelser sammenlignet med en agarosegelmatrise.
Endre porestørrelse:
Porestørrelsen til polyakrylamidgeler kan endres på en mer kontrollert måte enn for agarosegeler.
Løsingskraft:
Polyakrylamidgeler har høy oppløsningsevne mens agarosegeler har lav oppløsningsevne.
Accommodating Nucleic Acid:
Polyakrylamidgeler kan romme større mengder nukleinsyre enn agarosegeler for oppløsning.
