Nøkkelforskjellen mellom Cosmid og Phagemid er på typen sekvenser den inneholder. Et kosmid inneholder et cos-sted og et plasmid. Derfor er det en hybridvektor mens et fagemid er et plasmid som inneholder et F1-replikasjonsorigo av F1-fagen.
Kosmider og fagemider brukes til kloningsformål, spesielt for å klone større fragmenter av DNA. Disse er mye brukt, spesielt i kloning av gener som er ansvarlige for produksjonen av ulike proteiner. Kosmider og fagemider blir enten replikert alene som plasmider eller pakket inn i virale partikler og deretter replikert.
Hva er en Cosmid?
Et kosmid, referert til som et hybridplasmid, omfatter cos-seter ekstrahert fra Lambda-fagpartikler og et plasmid. Disse cos-stedene er lange fragmenter av DNA med 200 basepar. Derfor har de sammenhengende eller klebrige ender som lar plasmidet passe inn i det virale DNA. Derfor er cos-stedene avgjørende for pakking av DNA.
Det er tre cos-sider;
- cosN-sted – involvert i å hakke DNA-tråden ved terminaseaktivitet
- cosB-nettsted – engasjert i å holde terminase.
- cosQ-nettsted – involvert i å forhindre nedbrytning av DNA av DNaser.
Figur 01: Cosmid
Kosmider kan også enten replikere enkelttrådet DNA eller dobbelttrådet DNA ved å bruke et passende replikasjonsorigo. Kosmider inneholder vanligvis antibiotikaresistensgener som markører for seleksjon av transformanter. Dermed kan bruken av et kosmid som vektor lette kloningen, og restriksjonsenzymfordøyelsen av vektoren kan deretter trekke ut disse fragmentene.
Hva er en Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, også k alt Phasmid, er også en type hybridvektor. Phagemid inneholder en spesiell replikasjonsopprinnelse k alt f1 replikasjonsopprinnelse. f1-opprinnelsen til replikasjon trekker ut fra en f1-fag.
Phagemid kan replikere både enkelt- og dobbelttrådet DNA. Replikering kan enten finne sted som et plasmid mens det gjennomgår uavhengig replikering eller kan bli pakket inn i fagpartikler og til slutt infisere bakteriell vert E coli. Når du infiserer E coli-cellene, krever f1-fagen tilstedeværelse av en pilus. Derfor er sexpili viktige under in vitro-pakking av Phagemids.
Hva er likhetene mellom Cosmid og Phagemid?
- Både Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer som brukes i rekombinant DNA-teknologi.
- Cosmid og Phagemid kan replikere enkelttrådet og dobbelttrådet DNA.
- Begge kan gjennomgå uavhengig replikering som ligner på plasmider.
- Cosmid og Phagemid kan gjennomgå in vitro-pakking og infisere bakterieceller.
- Både Cosmid og Phagemid krever et passende replikasjonsorigo for kloning.
Hva er forskjellen mellom Cosmid og Phagemid?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid er en hybridvektor som inneholder et cos-sted og et plasmid. | Phagemid er et plasmid som inneholder et F1-replikasjonsorigo for F1-fagen. |
| Tilstedeværelse av Cos-nettsteder | |
| Cos-nettsteder finnes i cosmid og er nødvendige for in vitro-emballasje. | Cos-nettsteder er fraværende i phagemid. |
| Tilstedeværelse av F1 Origin of Replication | |
| I cosmid kan fi-opprinnelsen for replikering forekomme eller ikke. | F1 replikasjonsopprinnelse er tilstede i fagemid. |
| Tilstedeværelse av antibiotikaresistente gener | |
| Antibiotika-resistente gener er tilstede i kosmider for å identifisere transformantene fra ikke-transformanter. | Antibiotika-resistente gener er fraværende i fagemider. |
| Krav for in vitro-emballasje | |
| Krever en cos-side. | Krever en sexpilus. |
Sammendrag – Cosmid vs Phagemid
Cosmid og Phagemid er kloningsvektorer som brukes i rekombinant DNA-teknologi. Kosmider er hybridvektorer som inneholder spesielle klebrige ender kjent som cos-steder. in vitro-emballasje krever disse cos-stedene. Mens fagmider er plasmider som inneholder en fl-replikasjonsopprinnelse ekstrahert fra f1-fag. Både kosmid og fagemid kan gjennomgå uavhengig replikering eller in vitro-pakking til bakterieceller. Dette er de viktige forskjellene mellom kosmid og fagmid.
