Nøkkelforskjellen mellom linker og adapter er at en linker ikke har sammenhengende ender mens en adapter har en sammenhengende ende.
DNA-ligering er prosessen med å koble to DNA-molekyler sammen, og danner fosfodiesterbindinger. Enzymet k alt DNA-ligase katalyserer denne reaksjonen. Det er et av de kritiske trinnene i moderne molekylærbiologiske felt som rekombinant DNA-teknologi og DNA-kloning. Ligeringseffektiviteten avhenger av endene til DNA-molekylene som skal ligeres. Det er to typer DNA-ender som klebrige ender og butte ender. Ligeringseffektiviteten er høy med klebrige ender enn med butte ender. Hvis mål-DNA-molekylene har butte ender, vil molekyler k alt adaptere eller linkere være nyttige. Adaptere og linkere er kjemisk syntetiserte oligonukleotidmolekyler som hjelper til med DNA-ligering. De har også interne restriksjonssteder. Adapteren har en klebrig ende og en butt ende, mens linker har to butte ender.
Hva er en Linker?
Linker er en kjemisk syntetisert oligonukleotidsekvens som er dobbelttrådet. Linker har to butte ender. Linker brukes til å ligere DNA-molekyler som har butte ender til vektorer. Den inneholder ett eller flere interne restriksjonssteder. Disse restriksjonsstedene fungerer som gjenkjennelsessteder for restriksjonsenzymer.
Figur 01: Linker
Etter ligering begrenses DNA igjen med restriksjonsenzymer for å produsere kohesive ender. EcoRI-linkere og sal-I-linkere er ofte brukte linkere.
Hva er en adapter?
An Adapter er en dobbelttrådet oligonukleotidsekvens som brukes til å koble to DNA-molekyler sammen. Det er en kort sekvens med en stump ende og en klebrig eller sammenhengende ende. Derfor består den av en enkelttrådet hale i den ene enden, noe som øker effektiviteten av DNA-ligering.
Figur 02: DNA-ligering med en adapter
I tillegg har adapteren interne restriksjoner. Derfor, etter ligering, kan DNA begrenses med passende restriksjonsenzymer for å skape en ny utstikkende ende. En ulempe med adaptere er at to adaptere kan danne dimmere ved baseparing med seg selv. Dette kan unngås ved å behandle dem med enzymet som kalles alkalisk fosfatase.
Hva er likhetene mellom kobling og adapter?
- Både linker og adapter er dobbelttrådede korte oligonukleotidsekvenser.
- De har interne restriksjoner.
- Dessuten er de kjemisk syntetiserte DNA-molekyler og er syntetiske molekyler.
- De kan koble to DNA-molekyler sammen.
- Etter ligering av linkere og adaptorer, begrenses DNA igjen med restriksjonsenzymer for å produsere klebrige ender.
Hva er forskjellen mellom kobling og adapter?
En linker er en kjemisk syntetisert kort oligonukleotiddupleks med to stumpe ender. En adapter er en kjemisk syntetisert kort oligonukleotiddupleks med en klebrig ende og en butt ende. Dermed er dette nøkkelforskjellen mellom linker og adapter. Dessuten kan adaptere danne dimerer, mens linkere ikke danner dimerer. Så dette er nok en betydelig forskjell mellom linker og adapter.
Nedenfor er en oppsummering av forskjellene mellom linker og adapter i tabellform.
Sammendrag – Linker vs Adaptor
Linker og adapter er to typer kjemisk syntetiserte oligonukleotider som er nyttige for å ligere stumpende DNA. Linker har to stumpe ender, mens adapter har en butt ende og en sammenhengende ende. Så dette er nøkkelforskjellen mellom linker og adapter. De er dobbelttrådete molekyler som har interne restriksjonssteder. De er mye brukt i rekombinant DNA-teknologi og DNA-kloning.
