Nøkkelforskjellen mellom dATP og ddATP er at dATP ikke terminerer DNA-syntese mens ddATP er i stand til å terminere DNA-syntese. Dette er fordi ddATP har et H-atom festet til 3ʹ-posisjonen til pentosesukkeret mens dATP har en OH-gruppe festet til 3ʹ-posisjonen.
dNTP-er er byggesteiner av DNA. Det er fire typer dNTP-er i henhold til purin- eller pyrimidinbasene - dATP en av dem. Den nitrogenholdige basen til dATP er adenosin. ddNTP-er er nukleotider som brukes i Sanger-sekvensering. Det er fire typer ddNTP-er. ddATP er en ddNTPs.
Hva er dATP?
Deoksyadenosintrifosfat er et nukleotid, som er en byggestein i DNA. DNA-polymeraseenzym bruker dATP som et substrat for DNA-syntese. dATP har tre komponenter: et deoksyribose-sukkermolekyl, et adenosin og de tre fosfatgruppene. Derfor er det et purin-nukleosidtrifosfat. Den kjemiske formelen til dATP er C10H16N5O12 P3, og dens molekylmasse er 491.182.
Figur 01: dATP
dATP skiller seg fra ATP (adenosintrifosfat) når det gjelder sukkerkomponenter. ATP har ribosesukker. dATP basepar med uracilnukleotid under transkripsjon. I tillegg til å delta i DNA-syntese, kan dATP fungere som et energioverførende molekyl for å opprettholde cellenes levedyktighet. Et høyt nivå av dATP i kroppen er giftig siden det kan fungere som en ikke-konkurrerende hemmer for enzymet ribonukleotidreduktase. Det kan føre til nedsatt immunforsvar.
Hva er ddATP?
Dideoxyadenosine triphoaphate eller ddATP er en av de fire typene nukleotider som brukes i Sanger-sekvenseringsmetoden. Strukturelt har ddATP også tre komponenter som ligner på dATP. De er en adeninbase, et deoksyribosesukker og tre fosfater.
Figur 02: ddATP
I motsetning til dATP, mangler ddATP en OH-gruppe i 3'-posisjonen til pentosesukkeret for å danne fosfodiesterbinding med det tilstøtende nukleotidet og fortsette kjedeforlengelsen. Den har et H-atom i 3'-posisjon. Derfor, når ddATP er inkorporert, slutter DNA-syntesen. Det er det grunnleggende prinsippet for Sanger-sekvensering. Derfor fungerer ddATP som en kjedeforlengelseshemmer i Sanger-sekvensering. Det er fire rør som brukes i Sanger-sekvensering og ddATP legges til ett rør.
Hva er likhetene mellom dATP og ddATP?
- dATP og ddATP er nukleotider.
- Begge er sammensatt av adenin, deoksyribose og tre fosfater.
- De er organiske forbindelser.
- Både dATP og ddATP legges til rør i Sanger-sekvensering.
Hva er forskjellen mellom dATP og ddATP?
dATP har en OH-gruppe i 3ʹ-posisjonen til pentosesukkeret mens ddATP mangler en OH-gruppe i 3ʹ-posisjonen til pentosesukkeret. Videre er dATP en monomer som brukes i DNA-syntese mens ddATP brukes til å avslutte kjedeforlengelse under Sanger-sekvenseringen. Så dette er nøkkelforskjellen mellom dATP og ddATP. Dessuten kan dATP danne fosfodiesterbindinger mens ddATP ikke kan danne fosfodiesterbindinger.
Infografikken nedenfor viser flere forskjeller mellom dATP og ddATP i tabellform for sammenligning side ved side.
Sammendrag – dATP vs ddATP
Kort fort alt er dATP en forløper til DNA-syntese mens ddATP er et nukleotid som brukes til å terminere DNA-syntese i Sanger-sekvensering. Dessuten har dATP en OH-gruppe i 3'-posisjon av pentosesukker, og den tillater dannelse av en fosfodiesterbinding med neste nukleotid. I mellomtiden mangler ddATP OH-gruppe i 3ʹ-posisjon; derfor er den ikke i stand til å danne en fosfodiesterbinding med neste nukleotid. Som et resultat slutter DNA-sekvensen sin forlengelse. Dermed oppsummerer dette forskjellen mellom dATP og ddATP.
